Взаимодействие алкилоксибензолов — ауторегуляторных d1-факторов микроорганизмов с ДНК
Диссертация
На основании описанных выше результатов гипотетическая модель взаимодействия между макромолекулой биополимера и низкомолекулярными АОБ развивается в три основных этапа. На первом этапе (часы, сутки) происходит комплексообразование ДНК с АОБ, в основном, за счёт взаимодействий алкильных радикалов АОБ с гидрофобными участками макромолекулы. На втором этапе (к 2−3 неделе) в локусах формирования… Читать ещё >
Список литературы
- Aaronson S. Chemical Communication at the Microbial Level. Florida: CRC Press, Inc. Boca Raton. 1981. V.l. P. 189- V.2. P. 203.
- Хохлов A.C. Низкомолекулярные микробные ауторегуляторы. M. Наука. 1988, С. 270.
- Олескин А.В. Надорганизменный уровень взаимодействия в микробных популяциях//Микробиология. 1993. Т.62. № 3. С.389−403.
- Oleskin A.V. Social behaviour of microbial populations // J. Basic Microbiol.1994. V.34.N6. P.425−439.
- Смирнов С.Г. Этология бактерий новое направление в исследовании прокариотов // Физико-химические исследования патогенных энтеро-бактерий в процессе культивирования. Иваново. ИвГУ. 1985. С.5−10.
- Олескин А.В., Ботвинко И. В., Цавкелова Е. А. Колониальная организация и межклеточная коммуникация у микроорганизмов // Микробиология. 2000. Т. 69. № 3. С. 309−327.
- Shapiro J.A. The significances of bacterial colony patterns // BioEssays.1995. V. 17. N7. P. 597−607.
- Gray K.M. Intercellular communication and group behavior in bacteria // Trends Microbiol. 1997. V.5. N 5. P.184−188.
- Олескин А.В. Экологически важные свойства популяций микроорганизмов // Соросовский образовательный журнал. 2001. Т.7. № 8. С. 7−12.
- Whittaker R. Н., Feeny P. P. Allelochemics: chemical interactions between species // Science. 1971. V. 171. P. 757—770.
- Law J.H., Regnier F.E. Pheromones // Annu. Rev. Biochem. 1971. V. 40. P. 533−548.
- Светличный В.А., Эль-Регистан Г.И., Романова А. К., Дуда В. И. Характеристики ауторегуляторного фактора d2, вызывающего автолиз клеток Pseudomonas carboxydoflava и Bacillus cereus // Микробиология. 1983. Т.52. № 1. С.33−38.
- Бухарин О.В., Гинцбург А. Л., Романова Ю. М., Эль-Регистан Г.И. Механизмы выживания бактерий. М.: Медицина. 2005. С. 367.
- Запрометов М.Н. Фенольные соединения: распространение, метаболизм и функции в растениях. М.: Наука. 1993. С. 272.
- Рогинский В.А. Фенольные антиоксиданты: реакционная способность и эффективность. М.: Наука. 1988. С. 247.
- Kozubek A., Tyman J.H.P. Resorcinolic lipids, the natural non-isoprenoid phenolic amphiphiles and their biological activity // Chem. Rev. 1999. V. 99. № 1. P. 1−31.
- Батраков С.Г., Эль-Регистан Г.И., Придачина H.H., Ненашев В. А., Козлова А. Н., Грязнова М. Н., Золотарёва И. Н. Тирозол ауторегуляторный фактор dj дрожжей Saccharomyces cerevisiae // Микробиология. 1993. Т. 62. № 4. С. 633−638.
- Reusch R.N., Sadoff H.L. 5-n-Alkylresorcinols from encysting Azotobacter vinelandii: isolation and characterization. // J. Bacteriol. 1979. V. 139. P. 448−453.
- Reusch R.N., Sadoff H.L. Novel lipid components of the Azotobacter vinelandii cyst membrane. //Nature. 1983. V. 302. P.268−270.
- Su C.-J., Reusch R.N., Sadoff H.L. Isolation and characterization of several unique lipids from Azotobacter vinelandii cyst. // J. Bacterid. 1981. V. 147. P. 80−90.
- Батраков С.Г., Придашина H.H., Кругляк Е. Б., Новогрудская Е. Д. Фенольные липиды из Azotobacter chroococcum // Хим. прир. соед. 1977. № 4. С. 494−499.
- Осипов Г. А., Эль-Регистан Г.И., Светличный В. А., Козлова А. Н., Дуда
- B.И., Капрельянц А. С., Помазанов В. В. Химическая природа ауторегу-ляторного фактора dl в Pseudomonas carboxydoflava // Микробиология. 1985. Т. 54. С. 186−190.
- Tsuge N., Mizokami М., Imai S., Shimazu A., Seto H. Adipostatins A and B, new inhibitors of glycerol-3phospate dehydrogenase // J. Antibiot. 1992. V. 45. P. 886−891.
- Эль-Регистан Г. И., Акилова Н. А., Хохлова Ю. М., Дужа М. В., Комарова Г. В. Ауторегуляторы начальных стадий развития Rhodotorula gracilis // Реферат научных сообщений 3-й Всес. биохим. съезда. Рига. 1974. Т.2.1. C.16.
- Эль-Регистан Г. И., Козлова А. Н., Комарова Г. В., Дужа М. В., Конова И. В., Красильников Н. А. Биология лучистых грибков. М.: «Наука». 1975. С. 130.
- Демкина Е.В., Соина B.C., Эль-Регистан Г.И., Звягинцев Д. Г. Репродуктивные покоящиеся формы Arthrobacter globiformis // Микробиология. 2000. Т. 69. № 3. С. 377−382.
- Демкина Е.В., Соина B.C., Эль-Регистан Г.И. Образование покоящихся форм Arthrobacter globiformis в автолизирующихся суспензиях // Микробиология. 2000. Т. 69. № 3. С. 383−388.
- Пронин С.В., Эль-Регистан Г.И., Шевцов В. В., Дуда В. И. Устойчивость покоящихся цистоподобных форм Bacillus cereus к воздействию высокой температуры, ультрафиолетовых лучей и низкомолекулярных спиртов //Микробиология. 1982. Т. 51. № 2. С. 314−317.
- Браун Г., Уолкен Дж. Жидкие кристаллы и биологические структуры. -М.: Мир. 1982. С. 190.
- Халатур П.Г. Самоорганизация полимеров // Соросовский образовательный журнал. 2001. Т. 7. № 4. С. 36−43.
- Дуда В.И., Королёв Ю. Н., Эль-Регистан Г.И., Дужа М. В., Телегин H. J1. Распределение и пространственная упорядоченность молекул биополимеров в покоящихся бактериальных спорах // Микробиология. 1978. Т. 47. № 4. С. 750−755.
- Бабусенко Е.С., Эль-Регистан Г.И., Градова Н. Б., Козлова А. Н., Осипов Г. А. Исследование мембранотропных ауторегуляторных факторов ме-танокисляющих бактерий // Успехи химии. 1991. Т. 60. № 11. С. 23 622 372.
- Комолова Г. С., Горская И. А., Каверинская Т. В., Шевелева И. Д. Влияние алкилрезорцина на дыхание, синтез нуклеиновых кислот и белка в изолированных тимоцитах//Биохимия. 1989. Т. 54. № 11. С. 1847−1851.
- Stasiuk М., Kozubek A. Modulation of 5-n-alkylresorcinol hemolytic properties by divalent cations. Dependence of the effect of cations on alkylresorci-nol structure // Cellular & Molecular Biology Letters. 1997. V. 2. P. 77−87.
- Kozubek A., Gubernator J., Przeworska E., Stasiuk M. Plarosomes, novel efficient phospolipid-amphiphile vesicles for drug delivery // Acta Biochimica Polonica. 2000. V. 47. № 3. P. 639−649.
- Марголис Л.Б., Бергельсон Л. Д. Липосомы и их взаимодействие с клетками. М.: Наука. 1986. С. 240.
- Kozubek A. Interaction of alkylresorcinols with proteins // Acta Biochim Pol. 1995. V. 42. № 2. P. 241−246.
- Марголис А.Л., Шерстюк С. Ф., Изумрудов В. А. Швядас В.Ю., Зезин А. Б., Кабанов В. А. Фазовые превращения в растворах полиэлектроли-товых комплексов как модель спорообразования // Доклады АН СССР. 1983. Т. 272. № 1.С. 230−233.
- Степаненко И.Ю. Изучение роли алкилоксибензолов в стрессовом ответе микроорганизмов. Автореф. дис.. канд. биол. наук. М.: ИНМИ РАН, 2005.
- Kamal-Eldin A., Pouru A., Eliasson C., Aman P. Alkylresorcinols as antioxidants: hydrogen donation and peroxyl radical-scavenging effects // Journal of the Science of Food and Agriculture. 2001. V. 81. № 3. P. 353−356.
- Hladyszowski J., Zubik L., Kozubek A. Quantum Mechanical and Experimental Oxidation Studies of Pentadecylresorcinol, Olivetol, Orcinol and Re-sorcinol // Free Rad. Res. 1998. V. 28. P. 359−368.
- Gasiorowski K., Szyba K., Brokos В., Kozubek A. Antimutagenic activity of alkylresorcinols from cereal grains. 1996. Cancer Letters. V. 106. P. 109 115.
- Gasiorowski K., Brocos B. DNA repair of hydrogen peroxide-induced damage in human lymphocytes in the presence of four antimutagens. A study with alkaline single cell gel electrophoresis (comet assay) // Cell. Moll. Biol. Lett. 2001. V. 6. P. 897−911.
- Маргулис А.Б., Ожиганова И. В., Бушманова O.B., Колпаков А. И., Ильинская О. Н. Гексилрезорцин как индуктор хромосомных аберраций в клетках периферической крови мышей // Генетика. 2005. Т. 41. № 8. С. 1045−1048.
- Прозоров А.А. Рекомбинантные перестройки генома бактерий и адаптация к среде обитания // Микробиология. 2001. Т. 70. № 5. С. 581−594.
- Головлёв В.Л. Метастабильность фенотипа у бактерий // Микробиология. 1998. Т. 59. № 2. С. 149−155.
- Милько Е.С., Егоров Н. С. Гетерогенность популяции бактерий и процесс диссоциации. -М.: Изд-во МГУ. 1991. С. 143.
- Дорошенко Е.В., Лойко И. Г., Ильинская О. И., Колпаков A.M., Горнова И. В., Эль-Регистан Г.И. Характеристика диссоциантов Bacillus cereus, штамм 504 //Микробиология. 2001. Т. 70. № 6. С. 811−819.
- Ильинская О.Н., Колпаков А. И., Шмидт М. А., Дорошенко Е. В., Мулю-кин А.Л., Эль-Регистан Г. И. Роль бактериальных ауторегуляторов роста группы алкилоксибензолов в ответе стафилококков на стрессовые воздействия //Микробиология. 2002. Т. 71. № 1. С. 23−29.
- Ильинская О.Н., Колпаков А. И., Зеленихин П. В., Круглова З. Ф., Чой-даш Б., Дорошенко Е. В., Мулюкин А. Л., Эль-Регистан Г. И. Влияние ау-тоиндукторов анабиоза на геном микробной клетки // Микробиология. 2002. Т. 71. № 2. С. 194−199.
- Hecht S.M. Naturals products that cleave DNA // Pure & Appl. Chem. 1989. V. 61. № 3. P. 577−580.
- Scannell R.T., Barr J.R., Murty V.S., Reddy K.S., Hecht S.M. DNA Strand Scission by Naturally Occurring 5-Alkylresorcinols // J. Am. Chem. Soc. 1988. V. 110. P. 3650−3651.
- Lytollis W., Scannell R.T., An H., Murty V.S., Reddy K.S., Barr J.R., Hecht S.M. 5-Alkylresorcinols from Hakea trifurcate That Cleave DNA // J. Am. Chem. Soc. 1995. V. 117. P. 12 683−12 690.
- Barr J.R., Murty V.S., Yamaguchi K., Singh S., Smith D.H., Hecht S.M. 5-Alkylresorcinols from Hakea amplexicaulis That Cleave DNA // Chem. Res. Toxycol. 1988. V. 1. P. 204−207.
- Singh U.S., Scannell R.T., An H., Carter B.J., Hecht S.M. DNA Cleavage by Di- and Trihydroxyalkylbenzenes. Characterization of Products and the
- Roles of 02, Cu (II), and Alkali //J. Am. Chem. Soc. 1995. V. 117. P. 1 269 112 699.
- Starck S.R., Deng J.Z., Hecht S.M. Naturally occurring alkylresorcinols that mediate DNA damage and inhibit its repair // Biochemistry. 2000. V. 39. № 9. P. 2413−2419.
- Deng J.Z., Starck S.R., Hecht S.M. bis-5-Alkylresorcinols from Panopsis rubescens that inhibit DNA polymerase beta // J. Nat. Prod. 1999. V. 62. № 3. P. 477−480.
- Маргулис А.Б. Низкомолекулярные ауторегуляторные соединения как триггерные молекулы стресса у бактерий. Автореф. дис.. канд. биол. наук. Казань: КГУ, 2005.
- Кнорре Д.Г., Мызина С. Д. Биологическая химия. М.: Высш. шк. 1998. С. 479.
- Фрайфелдер Д. Физическая биохимия. Применение физико-химических методов в биохимии и молекулярной биологии. -М.: Мир. 1980. С. 584.
- Дерябин Д.Г. Цитология про- и эукариотов. М: Академия. 2005. С. 239.
- Филиппович Ю.Б. Основы биохимии. М. Высш. шк. 1993. С. 496.
- Владимиров Ю.А., Рощупкин Д. И., Потапенко А. Я., Деев А. И. Биофизика.-М.: Медицина. 1983. С. 272.
- Благой Ю.П. Взаимодействие ДНК с биологически активными веществами (ионами металлов, красителями, лекарствами) // Соросовский образовательный журнал. 1998. № 10. С. 18−24.
- Зенгер В. Принципы структурной организации нуклеиновых кислот. -М.: Мир. 1987. С. 584.
- Москва В.В. Водородная связь в органической химии // Соросовский образовательный журнал. 1999. № 2. С. 58−64.
- Сорокин В.А. Взаимодействие ионов двухвалентной меди с природной ДНК и ее мономерами // Биофизика. 1994. Т. 39. Вып. 6. С. 993−1004.
- Благой Ю.П., Галкин В. Л., Гладченко Г. О. и др. Металлокомплексы нуклеиновых кислот в растворах. Киев: Наукова думка. 1991. С. 225.
- Карасёв В.Е., Бабий А. П. Комплексы Cu(II) с дегидратированной спиральной ДНК // Электронный журнал «Исследовано в России», 2003, Т.6, С. 1038−1048. http://zhurnal.ape.relarn.ru/articles/1998/003.pdf
- Шишниашвили Д.М., Лысцов В. Н., Мошковский Ю. Ш. Об изменениях вторичной структуры ДНК под действием ионов палладия. В сб. Кон-формационные изменения биополимеров в растворах. М.: Наука. 1973. С. 207.
- Поляничко A.M., Чихиржина Е. В., Андрущенко В. В., Виезер Г., Воробьёв В. И. Спектральные исследования структуры комплексов ДНК сл Iионами Мп в УФ- и ИК-диапазонах // Биофизика. 2005. Т. 50. Вып. 5. С. 810−817.
- Андроникашвили Э.Л. Малигнизация и изменение некоторых физико-химических свойств биомакромолекул и надмолекулярных структур // Биофизика. 1987. Т. 23. С. 782−799.
- Бурилков В.Н., Крочик Г. М. Биологическое действие лазерного излучения. Институт хим. генетики. Кишенев: Штиинца, 1989. С. 101.
- Благой Ю.П., Сорокин В. А., Валеев В. А. Спектральное исследование связывания оснований ДНК с ионами магния и кальция // Молекулярная биология. 1980. Т. 14. Вып.З. С. 595−605.
- Bielawski К., Bielawska A., Bartulewicz D., Rozanski A. Molecular modeling of the interaction of carbocyclic analogues of netropsin and distamycin with d (CGCGAATTCGCG)2 // Acta Biochimica Polonica. 2000. V. 47. № 3. P. 855−866.
- Kraubauer R., Fischerlander S., Allen S., Gaub H.E. Mechanical fingerprints of DNA drug complexes // Single Mol. 2002. V. 3. P. 97−103.
- Ouameur A., Tajmir-Riahi H. Interactions with Biogenic Polyamines and Cobalt (III)hexamine Studied by Fourier Transform Infrared and Capillary Electrophoresis // J. Biol. Chem. 2004. V. 279. № 40. P. 42 041−42 054.
- Jary D., Sikorav J.L. Cyclization of globular DNA. Implications for DNA-DNA interactions in vivo // Biochemistry. 1999. V. 38. P. 3223−3227.
- Lin Z., Wang C., Feng X., Liu M., Li J., Bai C. The observation of the local ordering characteristics of spermidine- condensed DNA: atomic force microscopy and polarizing microscopy studies // Nucl. Acids Res. 1998. V. 26. P. 3228−3234.
- Стручков B.A., Стражевская Н. Б. Структурные и функциональные аспекты ядерных липидов нормальных и опухолевых клеток // Биохимия. 2000. Т. 65. Вып. 5. С. 620−643.
- Шабарчина Л.И., Сухоруков Б. И., Шванева Н. В., Коломийцева И. К. // Биофизика. 1975. Т. 20. С. 366−370.
- Manzoli F.A., Muchmore J.H., Bonora В., Sabioni A., Stefoni S. Interaction between sphingomyelin and DNA // Biochim. Biophys. Acta. 1972. V. 277. P. 251−255.
- ЮО.Алесенко A.B., Пантаз Э. А., Пушкарёва М. Ю., Русакова С. А., Филиппова Г. Н. //Биохимия. 1993. Т. 58. С. 461−470.
- Ю1.Шенгелия М. Г., Гачава М. М., Царцидзе М. А., Ламсадзе Б. А. // Биол. науки. 1984. № И. С. 34−36.
- Жданов Р.И., Дьячков Е. П., Стручков В. А., Стражевская Н. Б., Дьячков П. Н. ДНК-связанные липиды: моделирование взаимодействия ДНК со стеариновой и ненасыщенными жирными кислотами // Известия АН. Серия химическая. 2003. № 9. С. 1794−1800.
- Стручков В.А., Стражевская Н. Б. ДНК-связанные липиды: состав и возможные функции //Биохимия. 2000. Т. 58. Вып. 8. С. 1154−1175.
- Сухоруков Б.И., Петров А. И., Казарян P.JL, Кувичкин В. В. Изучение комплексообразования ДНК с катионными амфифильными молекулами методом флуоресцентного зонда // Биофизика. 2000. Т. 45. Вып. 2. С. 245−253.
- Скуридин С.Г., Дембо А. Т., Ефимов B.C., Евдокимов Ю. М. Жидкокристаллические фазы комплексов ДНК с синтетическими поликатионами // Доклады академии наук. 1999. Т. 365. № 3. С. 400−402.
- Bloomfield V.A. DNA condensation by multivalent cations // Biopolimers. 1997. V. 44. P. 269−282.
- Ю8.Тейф В. Б., Ландо Д. Ю. Конденсация ДНК, вызванная адсорбцией ли-гандов. Минск: Технопринт. 2003. С. 116−128.
- Sikorav J.L., Church G.M. Complementary recognition in condensed DNA: accelerated DNA renaturation//J. Mol. Biol. 1991. V. 222(4). P. 1085−108.
- Jary D., Sikorav J.L. Cyclization of globular DNA. Implications for DNA-DNA interactions in vivo // Biochemistiy. 1999. V. 38(11). P. 3223−3227.
- J. Kindt, S. Tzlil, A. Ben-Shaul, and W. M. Gelbart DNA packaging and ejection forces in bacteriophage // Proc. Natl. Acad. USA. 2001. V. 98. P. 13 671−13 674.
- Cockell M., Gasser S.M. Nuclear compartments and gene regulation // Curr. Opin. Genet. Develop. 1999. V. 9. P. 199−205.
- Dobrucki, J., and Darzynkiewicz, Z. Chromatin condensation and sensitivity of DNA in situ to denaturation during cell cycle and apoptosis. A confocal microscopy study // Micron. 2001. V. 32 (7). P. 645−652.
- Minsky A., Shimoni E., Frenkiel-Krispin D. Stress, order and survival // Nat. Rev. Mol. Cell. Biol. 2002. V. 3 (1). P. 50−60.
- S. Levin-Zaidman, J. Englander, E. Shimoni, AK. Sharma, KW. Minton, Minsky A. Ringlike structure of the Deinococcus radiodurans genome: A key to radioresistance? // Science. 2003. V. 299 (5604) P. 254−256.
- Azam T.A., Iwata A., Nishimura A., Veda S., Ischihama A. Growth phase-dependent variation in protein composition of the Escherichia coli nucleoid // J. Bacteriol. 1999. V. 181. № 20. P. 6361−6370.
- Setlow P. Mechanisms for the prevention of damage to DNA in spores of Bacillus species // Annu. Rev. Microbiol. 1995. V. 49. P. 29−54.
- Лохман Э.-Р., Михелер А. Связывание органических красителей с нуклеиновыми кислотами и фотодинамический эффект.- В кн.: Физико-химические свойства нуклеиновых кислот. М.: Мир. 1976. С.233−273.
- Морошкина Е.Б., Сафьянникова М. Г. Взаимодействие ДНК с соединениями феназинового ряда // Биофизика. 1999. Т. 44. № 3. С. 425−429.
- Li H.J., Crothers D.M. Relaxation studies of proflavine-DNA complex: the kinetics of an intercalation reaction // J. Mol. Biol. 1969. V. 39. P. 461−477.
- Wakelin L.P.G., Waring M.G. Kinetics of drug-DNA interaction. Dependence of the binding mechanism on structure of the ligand // J. Mol. Biol. 1980. V. 144. P. 183−214.
- Coury J.E., Anderson J.R., McFail-Isom L., Williams L.D. and Bottomley L.A. Scanning Force Microscopy of Small Ligand-Nucleic Acid Complexes: Tris (o-phenanthroline)ruthenium (II) as a Test for a New Assay // J. Am. Chem. Soc. 1997. 119. P. 3792−3796.
- Lerman L.S. Structural considerations in the interaction of DNA and acridi-nes // J. Mol. Biol. 1961. V.3.P. 18−30.
- Gale E.F., Cundliffe F., Reynolds P.E., Richmond M.H., Waring M.J. The molecular Basis of Antibiotic Action. 1972. London: Wiley. P. 102−115.
- Waring M.J. DNA modification and cancer // Ann. Rev. Biochem. 1981. V. 50. P. 159−92.
- Berman H.M., Young P.R. The interaction of intercalating drugs with nucleic acids//Annu. Rev. Biophys. Bioeng. 1981. V. 10. P. 87−114.
- Lee S.L., Debenedetti P.G., Errington J.R., Pethica B.A., Moore D.J. Calo-rimetric and Spectroscopic Study of DNA at Low Hydration // J. Phis. Chem. B. 2004. V. 108. № 9. P. 3098−3106.
- Сканирующая зондовая микроскопия биополимеров / Под ред. И. В. Яминского. -М.: Научный мир, 1997. С. 87.
- Reichmann М.Е., Rice S.A., Tomas С.A., Doty P. A further examination of the molecular weight and size of the desoxypentose nucleic acid. // J. Amer. Chem. Soc. 1954. V.76. P. 3047−3053.
- Молекулярная клиническая диагностика. Методы: Пер. с англ. / Под ред. С. Херрингтона, Дж. Макги. М.: Мир, 1999. С. 558.
- Falk В.М., Hartman, К.A., Lord, R.C. Hydration of deoxyribonucleic acid. A spectroscopic study of the effect of hydration on the structure of deoxyribonucleic acid // J. Am. Chem. Soc. 1963. V. 85. P. 391−394.
- Рабек Я. Экспериментальные методы в химии полимеров: в 2-х частях. Ч. 1.-М.: Мир. 1983. С. 384.
- Методы исследования белков и нуклеиновых кислот / Под ред. Ю. С. Лазуркина. М.: Наука, 1967. — С. 343.
- Волькенштейн М.В. Молекулярная биофизика. Т.1 -М.: Наука. 1975. С. 616.
- Кочетков И.К., Будовский Э. И., Свердлов Е. Д., Симукова Н. А. Турчин-ский М.Ф., Шибаев В. Н. Органическая химия нуклеиновых кислот. 1970. М.: Химия. С. 720.
- Ашмарин И.П. Молекулярная биология. Избранные разделы. 1974. М.: Медицина. С. 360.
- Галь Э., Медьеши Г., Верецкеи Л. Электрофорез в разделении биологических макромолекул: Пер. с англ. -М.: Мир, 1982. С. 448.
- Маниатис Т. и др. Методы генетической инженерии. Молекулярное клонирование: Пер. с англ. М.: Мир, 1984. С. 480.
- MO.Engel A., Schoenenberger С.A., Miiller D.J. High resolution imaging of native biological sample surfaces using scanning probe microscopy // Current Opinion in Structural Biology. 1997. № 7. P. 279−284.
- Engel A., Lyubchenko Y. and Miiller D. Atomic force microscopy: a powerful tool to observe biomolecules at work // Trends in Cell Biology. 1999. № 9. P. 77−80.
- You H.X., Lowe C.R. Progress in the application of scanning probe microscopy to biology // Current Opinion in Biotechnology. 1996. № 7. P. 78−84.
- Geisler В., Noll F., Hampp N. Nanodissection And Noncontact Imaging Of Plasmid DNA With An Atomic Force Microscope // Scanning. -2000. V. 22. P. 7−11.
- Bustamante C., Vesenka J., Tang C., Rees W., Guthold M., Keller R. Circular DNA Molecules imaged in air by scanning force microscopy // Bioochemistry. 1992. -№ 31. — P. 22−26.
- Галлямов M.O., Яминский И. В. Сканирующая зондовая микроскопия нуклеиновых кислот. М.: Центр перспективных технологий, 1998. — С. 20.
- Murray M.N., Hansma H.G., Bezanilla М., Sano Т., Ogletree D.F., Kolbe W., Smith C.L., Cantor C.R., Sengler S., Hansma P.K., Salmeron M. Atomic force microscopy of biochemically tagged DNA // Proc.Natl.Acad.Sci. USA. 1993. № 90. P.811−3814.
- Вудраф Д., Делчар Т. Современные методы исследования поверхности.-М.: Мир. 1989. С. 568.
- Фелдман JL, Майер Д. Основы анализа поверхности и тонких пленок. -М.: Мир. 1989. С. 342.
- Основы аналитической электронной микроскопии. / под ред. Дж. Грена. Дж. И. Гольштейна, Д. К. Джоя, А. Д. Ромига. М.: Металлургия, 1990. С. 584.
- Векшин H.JI. Фотоника биологических структур. Пущино: ОНТИ НЦБИ АН СССР, 1988. С. 164.
- Tinoco I. // J. Amer. Chem. Soc. 1960. V. 82. № 18. P. 4785−4790.
- Лакович Дж. Основы флуоресцентной спектроскопии. Пер. с англ. М.: Мир. 1986. С. 496.
- Добрецов Г. Е. Флуоресцентные зонды в исследовании клеток, мембран и липопротеинов. 1989. М.: Наука. С. 276.
- Гаврилов В.Б., Конев С. В., Калоша И. И. Люминесцентные свойства пи-ронового красного нового молекулярного зонда для исследования белков // Журнал прикладной спектроскопии. 1999. Т. 66. № 3. С. 369 374.
- Kalyanasundaram К., Thomas J.K. Environmental Effects on Vibronic Band Intensities in Pyrene Monomer Fluorescence and Their Application in Studies of Micellar Systems // Journal of the American Chemical Society. 1977. Vol. 99. № 7. P. 2039−2044.
- Ильинская О.Н., Колпаков А. И., Зеленихин П. В., Круглова З. Ф., Чойдаш Б., Дорошенко Е. В., Мулюкин А. Л., Эль-Регистан Г.И. Влияние аутоин-дуктооров анабиоза бактерий на геном микробной клетки // Микробиология. 2002. Т. 71. № 2. С. 194−199.
- Нечипуренко Ю.Д., Рябоконь В. Ф., Семёнов С. В., Евдокимов Ю. М. Термодинамические модели, описывающие образование «мостиков» между молекулами нуклеиновых кислот в жидких кристаллах // Биофизика. 2003. Т. 48. Вып. 4. С. 635−643.
- Евдокимов Ю.М. Жидкокристаллические формы нуклеиновых кислот // Вестник РАН. 2003. Т. 73. № 8. С. 712−721.
- Жижина Г. П., Олейник Э. Ф. Инфракрасная спектроскопия нуклеиновых кислот// Успехи химии. 1972. Т. 41. № 3. С. 474−511.
- Mohr S., Sokolov N., Не С., Setlow P. Binding of small acid-soluble spore proteins from Bacillus subtilis chanches the conformation of DNA from В to A // Biochemistry. 1991. Vol. 88. P. 77−81.
- Иванов В.И., Минченкова JI.E. А-форма ДНК: в поисках биологической роли // Молекулярная биология. 1994. Т.28. С. 1258−1271.
- Taillander Е., Liquier J. Infrared Spectroscopy of DNA // Methods Enzymol. 1992. V. 211. P. 307−335.
- Sukhorukov B.I., Montrel M.M. Infrared and X-ray diffraction study of the effect of protonation of DNA on its B-to-A transition // Biophys. Chem. 1990 V. 35(1) P. 47−54.
- Ghomi M., Letellier R., Liquier J., Taillandier E. Interpretation of DNA vibrational spectra by normal coordinate analysis // Int. J. Biochem. 1990. Vol. 22. № 7. P. 691−699.
- Поляничко A.M., Чихиржина E.B., Андрущенко B.B., Виезер Г., Воробьёв В. И. Спектральные исследования структуры комплексов ДНК с ионами Мп в УФ- и ИК-диапазонах // Молекулярная биофизика. 2005. Т. 50. Вып. 5. С. 810−817.
- Ouameur A., Tajmir-Riahi Н. Interactions with Biogenic Polyamines and Cobalt (III)hexamine Studied by Fourier Transform Infrared and Capillary Electrophoresis // J. Biol. Chem. 2004. V. 279. № 40. P. 42 041−42 054.169. http://www.sigmaaldrich.com
- Монтрель M.M., Сухоруков Б. И. Влияние ионов водорода на Б-А переход в ДНК // Мол. биол. 1989. Т. 23. № 3. С. 699−707.
- Семёнов М.А., Сухоруков Б. И., Малеев В. Я. Гидратируются ли азотистые основания в ДНК при низких влажностях // Биофизика. 1981. Т. 26. Вып. 6. С. 979−984.
- Шабарчина Л.И., Монтрель М. М., Савинцев И. В., Сухоруков Б. И. Кон-формационное состояние ДНК в мультислойной плёнке с катионным амфифилом // Биофизическая химия. 2003. Т. 77. № 11. С. 2068−2074.
- Карасёв В.Е., Бабий А. П. Комплексы Cu(II) с дегидратированной спиральной ДНК // Электронный журнал «Исследовано в России», 2003, Т.6, С. 1038−1048. http://zhurnal.ape.relarn.ru/articles/1998/003.pdf
- Ivanov V.I., Minchenkova L.E., Minyat Е.Е., Frank-Kamenetskii M.D., Schyolkina A.K. The В to A transition of DNA in solution // 1974. J.Mol.Biol. V. 87. P. 817−833.
- Nelson R.G., Johnson W.C. Jr. Conformation of DNA in ethylene glycol // 1970. Biochem. Biophys. Res. Commun. V. 41. № 1. P. 211−216.
- Green. G., Mahler H. Conformational changes of deoxyribonucleic acid and polydeoxynucleotides in water and ethylene glycol. 1971. Biochemistry. V. 10. P. 2200−2216.
- Гагуа A.B., Маленков Г. Г., Тимофеев В. П., Дудич И. В. Полярность окружения как фактор, определяющий конформацию ДНК // 1978. Молекулярная биология. Т. 12. № 3. С. 669−675.
- Давыдова О.В., Каргов С. И., Влияние диэлектрической проницаемости растворителя и концентрации ДНК на процесс ее термической денатурации в водно-органических растворах // Вестн. Моск. Ун-та. Сер. 2. Химия. 1999. Т. 40. № 3. С. 152−154.
- Маргулис А.Б., Ильинская О. Н., Колпаков А. И., Эль-Регистан Г.И. Индукция SOS-ответа клетки под действием ауторегуляторных факторов микроорганизмов // Генетика. 2003. Т. 39. № 9. С. 1180−1184.
- Мулюкин А.Л., Луста К. А., Грязнова М. Н., Козлова А. Н., Дужа М. В., Дуда В. И., Эль-Регистан Г.И. Образование покоящихся форм Bacilluscereus и Micrococcus luteus // Микробиология. 1996. Т. 65. № 6. С. 782 789.
- Громов Б.В., Павленко Г. В. Экология бактерий: Учеб. пособие. Л.:Изд-во Ленинградского ун-та, 1989. 248с.
- Рубин А.Б. Биофизика, в 2-х томах. М.: Высшая школа, 1987.
- Tyrrell R.M. Induction of pyrimidine dimers in bacterial DNA by 365nm radiation// Photochem. And photobiol. 1973. — Vol. 17. — № 1, — P.69−73.
- Фрайкин Г. Я., Страховская М. Г., Рубин А. Б., Индуцирорванные све-тотм процессы защиты клеток от фотоповреждений // Биохимия. 2000. Т.65. Вып.6. С.865−875.
- Pospisilova S., Kypr J. UV Light-induced Duplex-to-duplex Crosslinking of DNA Molecules in Aqueous Ethanol Solutions // Photochemistry and Photo-biology. 1998. Vol. 67. № 4. P. 386−390.
- Фрайкин Г. Я. Механизмы УФ-индуцированных деструктивных и фото-модифицирующих реакций у микроорганизмов / Молекулярные механизмы биологического действия оптического излучения. М.: Наука, 1988.-232 с.
- Vagel A., Roo E. Alkylresorcinols rare chemicals available in bulk // In-nov. Pharm. Tech. 2004. C.94−95.
- Степаненко И.Ю., Мулюкин A.JI., Козлова А. Н., Николаев Ю. А., Эль-Регистан Г.И. Роль алкилоксибензолов в адаптации Micrococcus luteus к температурному шоку // Микробиология. 2005. Т. 54. № 1. С. 26−33.
- Мартиросова Е.И., Карпекина Т. А., Эль-Регистан Г.И. Модификация ферментов естественными химическими шаперонами микроорганизмов // Микробиология. 2004. Т. 73. № 5. С. 708−715.
- Будкер В.Г., Дегтярёв С. Х., Соколов А. В., Расщепление ДНК, адсорбированной на поверхности фосфолипидных мембран, рестриктазами типа II//Биохимия. 1986. Т.51. № 9. С. 1496−1498.