Геномный полиморфизм и нестабильность локусов, содержащих мини-и микросателлитные повторы ДНК у однополых видов ящериц рода Darevskia: Сем.
Lacertidae
Диссертация
При мейотическом партеногенезе существует несколько способов восстановления соматического числа хромосом — премейотический, интрамейотический и постмейотический. При премейотическом способе (премейотическая эндодупликация) удвоение числа хромосом происходит еще до мейоза, и в мейоз вступает клетка, содержащая двойной соматический набор хромосом, которые формируют псевдобиваленты. В процессе… Читать ещё >
Список литературы
- Астауров Б.Л., Демин Ю. С. Партеногенез у птиц. // Онтогенез. 1972. Т. 3. № 2. С.123 141.
- Банников А.Г., Даревский И. С., Денисова М. Н., Дроздов Н. Н., Иорданский Н. Н. Жизнь животных. М.: «Просвещение». 1969. Т. 6. С. 282 284.
- Гилберт С. Биология развития. М.: «Мир». Т. 1. 1993.
- Даревский И.С., Щербак Н. Н., Акклиматизация партеногенетических ящериц на Украине. // Природа. 1968. № 5. С. 93 94.
- Даревский И.С. Естественный партеногенез у некоторых подвидов скальных ящериц Lacerta saxicola Eversmann. // ДАН СССР. 1958. Т. 122. С. 730 732.
- Даревский И.С. Эволюция и экология партеногенетического размножения у пресмыкающихся / В сб.: Современные проблемы теории эволюции. М.: «Наука». 1993. С. 89−109.
- Джинчарадзе А.Г., Иванов П. Л., Рысков А. П. // ДАН СССР. 1987. 295. № 1, с. 360.
- Инге-Вечтомов С. Г. Генетика с основами селекции. М.: «Высшая школа». 1989.
- Кан Н.Г., Петросян В. Г., Мартиросян И. А., и др. ДНК фингерпринтинг партеногенетического вида ящериц Lacerta dahli: выявление геномного полиморфизма мини — и микросателлитных локусов. // Молекулярная биология, 1998. Т.32. № 5. С. 805−812.
- П.Конюхов Б. В., Платонов Е. С. Геномный импринтинг у млекопитающих. // Генетика. 2001. Т. 37. № 1. С. 5 17.
- Коул Чарльз Дж. Однополые ящерицы.// В мире науки, 1984. № 3. С. 50−57.
- Куприянова J1.A. Некоторые цитогенетические закономерности сетчатого видообразования однополых видов ящериц (Reptilia, Lacertidae) и других групп позвоночных животных. // Цитология. 1997. Т.39. № 2. С. 1089 1108.
- Куприянова JI.A. Генетическое разнообразие гибридных однополых видов и форм рода Lacerta (Lacertidae, Reptilia): его возможные цитогенетические механизмы, цитогенетика мейоза природных полиплоидных форм. // Цитология. 1999. Т.41. № 12. С. 1038- 1047.
- Маниатис Т., Фрич Э., Сэмбрук Дж. (1984) Методы генетической инженерии «Молекулярное клонирование». Москва, «Мир" — а стр. 163, 400−401 b — стр. 125,342 с-стр. 132 d — стр. 409−410
- Мартиросян И.А., Рысков А. П., Петросян В. Г. и др. Изменчивость мини- и микросателлитных маркеров ДНК в популяциях партеногенетической скальной ящерицыDarevskia rostombekoviJfTQKQTKKZ. 2002. Т.38. № 6. С. 828−835.
- Петросян В.Г./ Мониторинг биоразнообразия / Отв. Ред. Соколов В. Е. и др. Из-во РАН. 1997. С. 105−114.
- Потапов С.Г., Токарская О. Н., Семенова С. К., Данилкин А. А., Марков Г. Г., Рысков А. П. Диагностические возможности мультилокусных маркеров ДНК в систематике диких копытных животных. // Генетика. 1997. Т. 33. № 7. С. 961−966.
- Ротт Н.Н., Терская Е. Р. Диплоидный андрогенез. / В сб.: Методы биологии развития. М., 1974.
- Рысков А.П., Кан Н.Г., Мартиросян И. А и др. Повышенная вариабельность (ТСС)П микросателлитных локусов в популяциях партеногенетического вида ящериц Lacerta unisexualis Darevsky. // Генетика. 2000. Т. 36. № 11. С. 1501 1506.
- Семенова С.К., Фнленко А. Л., Васильев В. А. Использование полиморфных маркеров ДНК для дифференциации пород кур различного происхождения.// Генетика. 1996. Т. 32. № 6. С. 266−273.
- Сингер М, Берг П. Гены и Геномы. М.: «Мир». 1998. Т. 2. С.201 204.
- Струнников В.А., Лежко С. С., Степанова Н. Л. Клонирование тутового шелкопряда. //Генетика. 1983. Т. 19. № 1.С. 82−89.
- Токарская О.Н., Кан Н.Г., Петросян В. Г., и др. Вариабельность GATA-микросателлитных ДНК в популяциях партеногенетического вида ящериц Lacerta unisexualis Darevsky. il Генетика.2000.Т.36. № 5. С. 693 698.
- Уайт Р., Лалуэль Ж. М. Картирование хромосом при помощи ДНК-маркеров. // В мире науки. Мир. Москва. 1988. Т.4. С. 6 -15.
- Arcot S.S., Wang Z., Weber J.L., Deininger P.L. and Batzer M.A. Alu repeats: a source for the genesis of primate microsatellites.//Genomics. 1995. V.29. P. 136 144.
- Arribas O.J. Phylogeny and relationships of the mountain lizards of Europe and Near East (Archaeolacerta Merttens, 1921, Sensu Lato) and their relationships among the Eurasian Lacertid lizards.// Russian J. Herpetology. 1999. V.6. № 1. P. l 22.
- Baker C.S., Gilbert D.A., Weinrich M.T., Lambertsen R., Calambokidis J., McArdle В., Chambers G.K., and O’Brien J.O. Population Characteristics of DNA Fingerprints in Humpbuck Whales.// Journal of Heredity, 1993. V.84. P. 281−290.
- Bois P., Willianson J., Brown J. et al. A novel unstable mouse VNTR family expanded from SINE B1 elements.// Genomics. 1998. V.49. P.122−128.
- Botstain D., White R.L., Skolnick M., Davis R.V. Construction of a genetic linkage map in man using restriction fragment length polymorphisms// Amer. J. Hum. Genet., 1980. 32- P.314 331.
- Brock M.K. and White B.N. Multifragment alleles in DNA fingerprints of the parrot, Amazonia ventralis. ll J. of Heredity. 1991. V. 82(3). P. 209 212.
- Chacraborty R., Kimmel M., Stivers D.N., Davison L.J. Deka R. Relative mutation rates at di-, tri- and tetranucleotide microsatellite loci.// Proc. Natl. Acad. Sci. 1997. V. 94 P. 1041 1046.
- Cimino M.C. Meiosis in triploid all-female fish (Poeciliopsis, Poecilidae). // Science. 1972. V. 175. № 4029. P. 1484 1486.
- Cognetti C. Citogenetica della parthenogenesis negli ofidi. // Acho. Zool. Ital. 1961. V. 46. P. 89−122.
- Cole C.J., Dessauer H.C., Barrowclough G.F. Hybrid origin of a unisexual species of whiptail lizard, Cnemidophorus neomexicanus, in Western North America: new evidence and a review. // Amer Mus Novitat.1988. V.2905. P. 1−38.
- Cole C.J. and Townsend C.R. Parthenogenetic Lizard as Vertebrate Systems.//The Journal of Experimental Zoology. 1990. Supplement 4. P. 174−176.
- Collick A., Dunn M.G., Jeffreys A.J. Minisatellite binding protein Msbp-1 is a sequence-specific single-stranded DNA-binding protein.// Nucleic Acids Res. 1991. V. 19. P. 6399 6404.
- Colson I., Goldstein D.B. Evidence for complex mutations at microsatellite loci in Drosophila.//Genetics. 1999. V.152. P.617−627.
- Darevsky I.S., Kupriyanova L.A., Uzzel T. Parthenogenesis in Reptiels. / Biology of the Reptilia. 1985. V. l5.
- Dawley R.M. An introduction to unisexual vertebrates. // In: Dawley RM, Bogart JP (eds) Evolution and ecology of unisexual vertebrates. Bull New York State Museum (Albany. N.Y.). 1989.V. 466. P. l-18.
- Di Rienzo A., Peterson A.C., Garza J.C. et al. Mutational processes of simple sequence repeat loci in human populations.//Proc.Natl.Acad.Sci.USA. 1994. V.91. P.3166−3170.
- Djian P. Evolution of simple repeats in DNA and their relation to human disease // Cell. 1998. V. 94. P. 155−160.
- Downs F.L. Unisexual Ambystoma from the Bass Island of the Lake Eire. // Occas. Papers Mus. Zool. Univ. Michigan. 1978. V. 685. P. 1 36.
- Elder J.F., and Schlosser I. Jr. Extreme clonal uniformity of Proxinus eos/ neogaeus gynogens (Pisces: Cyprinidae) among variable habitants in northern Minnesota beaver ponds// Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 1995. V. 92. P. 5001 5005.
- Ellegren H., Linogren G., Primmer C.R., Moller A.P. Fitness loss and germline mutations in barn swallows breeding in Chernobyl.//Nature. 1997. V. 389.
- Epplen J.T. On simple repeated GATA/GACA sequences in animal genome a critical reappraised. // J. Of Heredity. 1988. V. 79. P. 409 -1417.
- Fu J., MacCulloch R. D, Murphy R.W., et al. The parthenogenetic Rock Lizard Lacerta unisexualis: An Example of Limited Genetic Polymorphism. // J.Mol.Evol.1998. V. 46. P. 127- 130.
- Fu J., MacCulloch R. D, Murphy R.W., Darevsky I.S. Clonal variation in the Caucasian rock lizard Lacerta armeniaca and its origin. //Amphibia-Reptilia. 2000.Vol. 21. P.83−88.
- Gibbs M., Collick A., Kelly R.G., Jeffreys A.J. A tetranucleotide repeat mouse minisatellite displaying substantial somatic instability during early preimplantation development.//Genomics. 1993. V. 17. P. 121 128.
- Gilbert D.A., Lehman N., O’Brien S.J. & Wayne R.K. Genetic fingerprinting reflects population differentiation in the California Channel Island fox.// Nature. 1990. V. 344- P. 764−766.
- Gibert N. And Labuda D. Core SINEs: Eukaryotic short interspersed retroposing elements with common sequence motifs.// Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 1999. V. 96. P. 2869−2874.
- Gilbert D.A., Pacer C., Pusey A.E., Stephens J.C., and O’Brien S.J. Analitical DNA Fingerprinting in Lions: Parentage, Genetic Diversity, and Kinship.// Journal of Heredity. 1991. V. 82. P. 378−386.
- Goldstein D.B. and Pollock D.D. Launching microsatellites: a review of mutation processes and methods of phylogenetic inference.//J.of Heredity. 1997. V.88. P.335−342.
- Gourdon G., Radvanyi F., Lia A.-S., Duros C., Blanche M., Abitbol M., Junien C., Hofinann- Radvanyi H. Moderate integrational and somatic instability of a 55-CTG repeat in transgenic mice.//Nature Genetics. 1997. V. 15. P. 190 193.
- Green H. and Djian P. Amino acid repeats in proteins and the neurological disease produced by polyglutamine./ In Genetic Instabilities and Hereditary Neurological Diseases, R.D.Wells and S.T.Warren eds. New York: Academic Press. P. 739 759.
- Harrington R.W. // J. Science. 1961. 134. P. 1749 1750.
- Hill W.G. DNA fingerprints applied to animal and bird population // Nature. 1987. V.327- P. 98−99
- Hubbs C.L. and Hubbs L.C. 1946. Breeding experiments with the invariably female, strictly matroclinous fish. Molliensia Formosa. // Genetics. V. 31. P. 218.
- Hubbs C.L. Hybridization between fish species in nature.// Syst. Zool. 1955. V.4. P. 1−20.
- Jeffreys A.J., Wilson V., Tein S.L. Hypervariable minisatellite regions in human DNA // Nature. 1985. V. 314. P.67−73.
- Jeffreys A.J. // Biochem. Soc. Trans. 1987. V.15. P.309.
- Jeffreys AJ, Royle NJ, Wilson V, Wong Z. Spontaneous mutation rates to new length alleles at tandem-repetitive hypervariable loci in human DNA.// Nature. 1988. V. 322. P. 278−281.
- Jeffreys A.J., Allen M.J., Armour J.A., et al. Mutation processes at human minisatellites// Electrophoresis. 1995. V. 16. P. 1577 1585.
- Jeffreys A. J, Bois Ph., Buard J. et al. Spontaneous and induced minisatellite instability.// Electrophoresis. 1997. V. 18. P. 1501−1511.
- Jin L., Macaubas C., Hallmayer J. et al. Mutation rate varies among alleles at a microsatellite locus: Phylogenetic evidence.//Proc.Natl.Acad.Sci.USA. 1996. V.93. P.15 285- 15 288.
- Kelly R.G. Similar origins of two mouse minisatellites within transposon-like LTRs.// Genomics. 1994. V. 24. P. 509 515.
- Kruglyak S., Durrett R.T., Schug M.D., Aquadro C.F. Equilibrium distributions of microsatellite repeat length resulting from a ballanca between slippage events and point mutations.//Proc.Natl.Acad.Sci.USA. 1998. V.95. P. 10 774−10 778.
- Laughlin T.F., Lubinski B.A., Park E.H. et al Clonal stability and mutation in the self-fertilizing hermaphroditic fish, Rivulus marmoratus. // J. of Heredity. 1995. V. 85(6). P. 399−402.
- Lang J.W., Addarwal R.K., Majumdar K.C., Singh L. Individualization and estimation of relatedness in crocodilians by DNA fingerprinting with a Bkm-derived probe.// Mol.Gen.Genet. 1993. V. 238. P.49−58.
- Lichtenstein A.V., Moiseev V.L., Zaboikin M.H. A procedure for DNA and RNA transfer to membrane filters avoiding weight-induced gel flattening.// Anal.Biochem. 1990. V. 15. № 1. P.187−191.
- MacCulloch R.D., Murphy R.W., Kupriyanova L.A., et al. Clonal variation in the parthenogenetic rock lizard Lacerta armeniaca.// Genome. 1995. V.38. P. 1057- 1060.
- MacCuloch R.D., Murphy R.W., Kupriyanova L.A., Darevsky I.S. The Caucasian rock lizard Lacerta rostombekovi: a monoclonal parthenogenetic vertebrate. // Biochem System. Ecology. 1997. V. 25. № 1. P. 33 37.
- Macgregor H.C., Uzzell T.M. Gynogenesis in salamanders related to Ambystoma jeffersonianum. // Science. 1964. V. 143. No. 3. P. 1043 1045.
- Mahtani M.M., Willard H.F. A polymorphic X-linked tetranucleotide repeat locus displaying a high rate of new mutation: implication for mechanisms of mutation at short tandem repeat loci.//Hum.Mol.Genet. 1993. V.2. № 4. P. 431−437.
- Mangiarini L., Sathesivan K., Mahal А., Мой R., Seller M., Bates G.P.Instability of highly expanded CAG repeats in mice transgenic for the Huntington’s disease mutation.// Nature Genetics. 1997. V. 15. P. 197 200.
- Methew C.G.P. The isolation of high molecular weight eukaryotic DNA.- Methods in Molecular Biolog / Ed. Walker J.M.N.Y.- Humana press. 1984. V. 2. P. 31−34.
- Miller R.R., Schultz R.J. // Science. 1959. V. 130. No. 3389. P. 1656 1657.
- Moncton D.G., Coolbaugh M.I. Ashizawa K.T. Siciliano M.J. Caskey C.T. Hypermutable myotonic dystrophy CTG repeats in transgenic mice.//Nature Genetics. 1997. V. 15. P. 193- 196.
- Moore W.S., Miller R.R., Schultz R.J. // Evolution. 1970. V. 24. No. 4. P. 789 798.
- Moritz C., Donnelan S., Adams M., Baverstock P.R. The origin and evolution of parthenogenesis in Heteronotia binoei (Gekkonidae): extensive genotypic diversity among parthenogens. //Evolution. 1989. V.43. P.994−1003.
- Moritz C., Uzzel Т., Spolsky C., Hotz H., Darevsky I.S., Kupriyanova L.A., Danielyan F. The maternal ancestry and approximate age of parthenogenetic species of Caucasian rock lizards (Lacerta: Lacertidae). //Genetica, 1992, Vol. 87, P. 53−62.
- Murphy R.W., Darevsky I.S., MacCulloch R.D., et al. Olde age, multiple formations or genetic plasticity, Clonal diversity in the uniparental Caucasian rock lizard, Lacerta dahli. // Genetica. 1997. V. 101. P. 125 130.
- Nakamura Y. et al.// Science. 1987. V. 235. P.1616−1622.
- Ogiwara I., Miya M., Ohshima K., and Okada N. Retropositional parasitism of SINEs on LINEs: Identification of SINEs and LINEs in Elasmobranches.// Mol.Biol.Evol. 1999. 16(9). P. 1238−1250.
- Orti G., Pearse D.E., Avise J. Phylogenetic assessment of length variation at a microsatellite locus.//Proc Natl. Acad. Sci. USA. 1997. V.94. P. 10 745−10 749.
- Parker E.D. Phenotypic consequences of parthenogenesis in Cnemidophorus lizards. Invariability in parthenogenetic and sexual populations.//Evolution.l979.V.33.P.l 1 501 166.
- Rasch E.M., Monaco P.J., Balsano J.S. Cytophotometric and autoradiographic evidence for functional apomicsis in a unisexual fish Poecilia Formosa and its related triploid unisexuals. // Histochemistry. 1982. V. 73. P. 515 523.
- Reik W., Collick A., Norris L., Surani. Genomic imprinting determines methylation of a female mule and jack donkey. // J. Hered. 1987. V. 76. P. 248 251.
- Ryskov A.P., Jincharadze A.G., Prosniak M.I., Ivanov P.L., Limborska S.A.// FEBS Lett. 1988. V. 233. № 2. P 388.
- Rubinsztein D.C., Amos W., Leggo J. et al. Microsatellites are generally longer in humans compared to their homologes in non human primates: evidence for directional evolution at microsatellite loci.//Am.J.Hum.Genet. 1995. V.57. P.214.
- Schafer R., Zischler H., Epplen J.T. //Nucl. Acid Res. 1988. V.16. № 11. P.5196.
- Sclartl M., Nanda I., Schlupp I., et all. Incorporation of subgenomic amounts of DNA as compensation for mutational load in a gynogenetic fish. // Nature. 1995. V. 373.P.68−67.
- Schlotterer С. Tautz D. Slippage synthesis of simple sequence DNA.//Nucl. Acids Res.1992. V.20. P.211−215.
- Schultz R.J., Hybridization, unisexuality and polyploidy in the teliost Poeciliopsis (Poeciliidae) and other vertebrates. // Am. Nat. 1969. V. 103. No 934. P. 605 619.
- Schultz R.J. Unisexual fish: Laboratory synthesis of a «species». // Science. 1973. V. 179. No 4069. P. 180−181
- Southern E. // Method Enzymol. 1975. V. 69. P. 152
- Spruell P. And Thorgaard G.H. Sine sequences detect DNA fingerprints in salmonid fishes.//Heredity. 1996. V. 17. P. 317 324.
- Strand M., Prolla T.A., Liskay R.M., Petes T.D. Destabilization of tracts of simple repetitive DNA in yeast by mutations affecting DNA mismatch repair.// Nature.1993. V. 365. P. 274−276.
- Surani M.A.N., Barton S.C., Norris L.M. Development of reconstituted mouse eggs suggests imprinting of the genome in gametogenesis. // Nature. 1984. V. 308. P. 548 -550.
- Thein S.L., Wallace R.B., in Davies K.E. (ed) // Human Genetic Diesis: A Practical Approach.- IRL Press, Oxford. 1986. P.33−50.
- Tokarskaya O.N., Pertosyan V.G., Kashentseva Т., Panchenko V.G., Ryskov A.P. //Electrophoresis. 1995. V. 16. P. 1766−1770.
- Turner B.J., Elder J.F., Laughlin Т.Н., and Davis W.P. Genetic variation in clonal vertebrates detected by simple sequence DNA fingerprinting// Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 1990. V. 87. P. 5653 5657. Evolution
- Turner В J, Elder J.F., Laughlin T.F., et al. Extreme clonal diversity and divergence in populations of a selfing hermaphroditic fish. // Proc Natl Acad Sci USA. 1992. V. 89. P.10 643−10 647.
- Umino T, Arai K, Maeda K, et al. Natural clones detected by multilocus DNA fingerprinting in gynogenetic triploid ginbuna Carassius langsdorfii in the Kurose River, Hiroshima. // Fish Sci. 1997. V. 63 P. 147−148.
- Uzzell T.M. Relations of the diploid and triploid species of Ambystoma jeffersonianum complex (Amphiboa, Caudata). // Copeia. 1964. V. 2. P. 257 300.
- Uzzell Т., Darevsky I.S. Biochemical evidence for the hybrid origin of the parthenogenetic species of the Lacerta saxicola complex (Sauna: Lacertidae), with a discussion of some ecological and evolutionary implications. // Copeia. 1975. P. 204−222.
- Valdes A.M., Slatkin M., Freimer N.B. Allele frequencies at microsatellite loci: the stepwise mutation model revisited.// Genetics. 1993. V.133. P.737−749.
- Vassart G., Georgies M., Monsieur R., Brocas H., Lequarre A.S., Christophe D. A Sequences in M13 Phage Detects Hypervariable Minisatellites in Human and Animal DNA.// Science. 1987. V. 235. P. 683−684.
- Vergnaud G., Mariat D., Apiou F., et al. The use of synthetic tandem repeats to isolate new VNTR loci: cloning of a human hypervariable sequence. // Genomics. 1991. V. 11. P. 135- 144.
- Vilkki S., Loukola A., Poyhonen M., Vierimaa O., Herva R., Aaltonen L.A., Shibata D. Extensive somatic microsatellite mutations in normal human tissue.// Cancer Research. 2001. V. 61. P. 4541−4544.
- Vorlickova M., Keinovska I., Kovanda J., Kypr J. Conformational properties of DNA strands containing guanine-adenine and thymine-adenine repeats.// Nucleic Acids Res. 1998. V. 26 (6). P. 1509 1514.
- Vrijenhoek R.C., Schultz R.J., Evolution of a trihybrid unisexual fish (Poeciliopsis, Poecilidae). // Evolutional, Lancaster, Pa. 1974. V. 28. P. 306 319.
- Wahls D.P. Swenson G., Moore P.D. Two hypervariable minisatellite DNA binding proteins.// Nucleic Acids Res. 1991. V. 19. P. 3269 3274.
- Weber J.L. Informativness of human (dC dA) n* (dG — dT) n polymorphismas.// Genomics. 1990. V. 7. P. 524 — 530.
- Weber JL, Wong C. Mutation of human short tandem repeats. //Hum Mol Gen. 1993. V.2. P. 1123−1128.
- Wells R.D. Molecular basis of genetic instability of triplet repeats. //J.Biol.Chem. 1996. V. 271, № 6. P. 2875 2878.
- Wyman A., White R. // Proc.Nat.Acad.Sci.USA. 1980. V. 77. P.6474.
- Wong Z., Wilson V., Jeffreys A.J., Thein S.L. // Nucl. Acids Res. 1986. V.14. P.4605.
- Yamazaki H., Nomoto S., Mishima Y., Kominami R. A 35-kDa protein binding to a cytosine-rich strand of hypervariable minisatellite DNA.// J. Biol. Chem. 1992. V. 267. P. 12 311 12 316.
- Zhivotovsky L.A., Feldman M.W. Microsatellite variability and genetic distances.// Proc.Natl.Acad.Sci.USA. 1995. V.92. P. l 1549−11 552.
- Выражаю искреннюю благодарность В. В. Носикову за внимание и интерес к работе.
- ГОСУДАРСГ^ЕКПА-О. БИБЛИОТЕКАо г^ъч v — сл