Интегрированная система управления объектами метаданных при прогнозировании активности органических соединений
Диссертация
Решение о выборе наиболее перспективных соединений на основе прогнозирования принимается на начальном этапе научных исследований базовых структур лекарственных препаратов, поэтому достоверность прогнозов очень важна. Для повышения достоверности прогнозирование активности соединений, как правило, выполняется не одним, а несколькими различными методами, с последующим сопоставлением полученных… Читать ещё >
Список литературы
- Ларичев О.И., Мошкович Е. М. Качественные методы принятия решений. — М., Наука. Физматлит. 1996.
- Трахтенгерц Э.А. Компьютерная поддержка принятия решения. М., Изд-во «Синтег», 1998.376 с.
- Моисеев Н.Н. Предисловие к книге Орловского С.А. Проблемы принятия решений при нечеткой исходной информации. М., Наука. 1981.
- Ларичев О.И. Объективные модели и субъективные решения. М., Наука. 1987.
- Slovic P., Fichhoff В., Lichtenstein S. Behaviorial decision theory. Annual Psychology Rev. vol. 28,1997.
- Бурляева Е.В., Гаврилов А. В. Система управления принятием решений при выборе перспективных сложных органических соединений // Приборы и системы. Управление, контроль, диагностика, № 11, 2002
- Cizek J., On The Correlation Problem in Atomic and Molecular Systems Calculations of Wavefunction Components and Ursell-Type Expansion Using Quantum Field Theoretical Methods // Journal of Chemical Physics, 45 (1966), p. 4256.
- Anzali S., Barnickel G., Cezanne В., Krug M., Filimonov D., Poroikov V. Discriminating between drugs and nondrugs by Prediction of Activity Spectra for Substances (PASS) //. Journal of Medical Chemistry, 2001,4 (15), pp. 2432−2437
- Renxiao Wang, Ying Gao, Liang Liu, and Luhua Lai All-Orientation Search and All-Placement Search in Comparative Molecular Field Analysis // Journal of Molecular Modeling, 4, pp. 276−283.
- Cramer R.D., Patterson D.E., Bunce J.D. Comparative molecular field analysis. Effect of shape on binding of steroids to carrier proteins // Journal of American Chemical Society, 110,1988, pp.5959−5967
- Good A.C., So S.S., Richards W.G. Structure-activity relationships from molecular similarity matrices // Journal of Medical Chemistry, 36,1993, pp.433−438.
- Баскин И.И., Гальберштам H.M., Палюлин B.A., Зефиров Н.С. NASAWIN -программный комплекс для исследования зависимостей «структура свойство» в химии // Материалы 7-й Всероссийской конференции «Нейрокомпьютеры и их применение», Москва, 2001, с.419−422
- Баскин И. И., Палюлин В. А., Зефиров Н. С. Применение искусственных нейронных сетей в химических и биохимических исследованиях. Вестник Московского Университета. Химия. 1999, том 40, № 5, с. 323
- Bradbury S.P., Ankley G.T. The role of ligand flexibility in predicting biological activity // Environmental Toxical Chemistry, 17,1998, pp. 15−25
- Mekenyan O.G., Bradbury S.P., Ankley G.T. New Developments in a Hazard Identification Algorithm for Hormone Receptor Ligands: COREPA. Quantitative Structure-Activity Relationships in Environmental Sciences, 7,2000, pp.141−158.
- Mekenyan O.G., Schultz T.W., Veith G.D. Dynamic QSAR: A new search for active conformations and significant stereoelectronic induces. Quantitative Structure Activity Research, 13,1994, pp.302−307S
- Голендер В. Е., Розенблит А. Б., Журнал ВХО им. Д. И. Менделеева, 25,1980, № 1, с. 28−35.
- Leo A.J., Calculating log Poct from Structures. // Chemical Review, № 4 (93), 1993, pp. 120−146.
- Бурштейн К.Я., Шорыгин П. П. Квантовохимические расчеты в органической химии и молекулярной спектроскопии.- М:. Наука, 1989.-104 с.
- Буч Г., Рамбо Д. Якобсон И. Язык UML. Руковоство пользователя. 2-е изд.: Пер. с англ. Мухин. М.: ДМК Пресс, 2007. — 496 с.
- Леоненков А.В. Самоучитель UML. СПб.: БХВ-Петербург, 2001.- 304 с
- Rolf Hennicker, Nora Koch: Modeling the User Interface of Web Applications with UML. pUML 2001: 158−172
- Designing Reusable Classes Ralph E. Johnson & Brian Foote Journal of Object-Oriented Programming June/July 1988, Volume 1, Number 2, pages 22−35
- Erich Gamma, Richard Helm, Ralph Johnson, and John Vlissides, «Design Patterns: Elements of Reusable Software Architecture», Addison-Wesley, 1995.
- Ralph E. Johnson Components, frameworks, patterns Proceedings of the 1997 symposium on Software reusability Boston, Massachusetts, United States, 1997, pp. 10−17
- Prakash M. Nadkarni, Luis Marenco, Roland Chen, Emmanouil Skoufos, Gordon Shepherd, Perry Miller Organization of Heterogeneous Scientific Data Using the EAV/CR Representation J Am Med Inform Assoc. 1999 Nov-Dec- 6(6): 478−493.
- Фаулер M. Архитектура корпоративных программых приложений.: Пер. с агнл. -М.: Издательский дом «Вильяме», 2007. 544 с.
- Басс JI., Клементе П., Кацман Р Архитектура программного обеспечения на практике СПб.: Питер, 2006
- Shaw М. and Clementz P. A Field Guide to Boxology: Preliminary Classification of Architectural Styles for Software Systems Proceeding of COMPSAC, Washington, D.C., August 1997
- Кулямин В. В Технологии программирования. Компонентный подход. Интернет-университет информационных технологий ИНТУИТ.ру, БИНОМ. Лаборатория знаний, 2006 г., 464 стр. 33. © Sun microsystems www.sun.com
- Иванова Е.Б., Вершини М.М. Java 2, Enterprise Edition. Технологии проектирования и разработки. СПб.: БХВ- Петербург, 2003. — 1088 с. 35. (c)Interface21 www.springframework.org
- Rob Harrop, Jan Machacek Pro Spring: Apress, 2005.
- Rod Johnson, Juergen Hoeller Expert One-on-One J2EE Development without EJB Wiley Pablishing, Inc., Indianapolis, Indiana 2004, 552 p.
- Martin Fowler Inversion of Control Containers and the Dependency Injection pattern www.martinfowler.com/articles/injeetion.html
- G. Kiczales, J. Lamping, A. Mendhekar, etc. Aspect-oriented programming. Published in proceedings of the European Conference on Object-Oriented Programming (ECOOP). Finland, Springer-Verlag LNCS 1241. June 1997.40. www.mysql.com
- Kohlstaedt L.A., Wang J., Friedman J.M. at all Crystal Structure at 3,5 A Resolution of HIV-1 Reverse Transcriptase Complexed with an Inhibitor // Science, 1992, 256, pp.1783−1790.
- Ren J., Esnouf R., Hopkins A. at all The structure of HIV-1 reverse transcriptase complexed with 9-cloro-TIBO: lessons for inhibitor design// Structure, 1995, 3, pp. 915 926.51. dasher.wustl.edu/tinker
- Silverman B.D., Piatt D.E. Comparative Molecular Moment Analysis: 3D-QSAR without Molecular Superposition // Journal of Medicinal Chemistry, 1996, vol.39, № 11, pp.21 292 140.
- Kukla M.J., Breslin H.J., Diamond C.J. et al. (1991) Journal of Medicinal Chemistry, vol.34, 3187.
- Бурляева E.B. Информационная система прогнозирования ингибирующей активности ненуклеозидных ингибиторов обратной транскриптазы // Биомедицинские технологии и радиоэлектроника, № 6,2003, с.28−33
- Бурляева Е.В., Комардин П. В., Юркевич A.M., Швец В. И. Уточнение прогноза активности ингибиторов ВИЧ с учетом их конформации в активном центре фермента // Химико-фармацевтический журнал, № 9,2003, с.31−35
- Использование ненуклеозидных ингибиторов обратной транскриптазы в качестве антиВИЧ препаратов // Тезисы докладов 7-й международной научно-технической конференции «Наукоемкие химические технологии», Ярославль, Изд-во ЯГТУ, 2001, с. 102