Фотоактивируемые флуоресцентные красители для микроскопии биологических объектов
Диссертация
Научная новизна работы. Впервые получены и детально исследованы смешанные монослои новых ФФК и фосфолипидов, моделирующие взаимодействие ФФК с биологическими мембранами. Определена оптимальная концентрация ФФК для окрашивания клеток, разработаны методики активирования ФФК и визуализации с помощью флуоресцентной микроскопии. Впервые выполнена «прижизненная» микроскопия окрашенного монослоя клеток… Читать ещё >
Список литературы
- Албертс, Б. Молекулярная биология клетки / Б. Албертс, Д. Брей, Дж. Льюис, М. Рэфф, К. Роберте, Дж. Уотсон М.: Мир, 1996. Т. 1. — 517 с.
- Бойчук, Н.В. Гистология / Н. В. Бойчук, Исламов P.P., Улумбеков Э. Г., Челышев Ю. А. Гистология. М: Медицина, 1981. — 672 с.
- Буданцев, А.Ю. Основы гистохимии: Учебное пособие. Пущино, 2008.-215 с.
- Веселовский, В.А., Веселова Т. В. Люминесценция растений. Теоретические и практические аспекты. / В. А. Веселовский, Т. В. Веселова. -М.: Наука. 1990.-200 с.
- Владимиров, Ю.А. Флуоресцентные зонды в исследовании биологических мембран / Ю. А. Владимирова, Г. Е. Добрецов. М.: Наука. -1980.-320 с.
- Иванова, C.B. Фундаментальные, клинические и фармацевтические проблемы патологии человека: сб. науч. трудов. / C.B. Иванова, О. И. Кралько, И. П. Штурич // Витебск: ВГМУ. 2003. -№ 2. С. 191−193.
- Калганова, Е.В. Измерение квантового выхода флуоресценции производных тиофлавина Т / Е. В. Калганова // Физика, Сб. науч. тр. 4.1 — Гродно., 2010. С.214−216.
- Кисели, Д. Практическая микротехника и гистохимия. / Д. Кисели. -Будапешт: АН Венгрии, 1962. 400 с.
- Кузнецов, А.Н. Метод спинового зонда / А. Н. Кузнецов М.: Наука. 1976.-210 с.
- Лакович, Дж. Основы флуоресцентной спектроскопии / Дж. Лакович. М.: Мир, 1986. — 488 с.
- Пальцев, М.А. Патологическая анатомия: Учебник. / М. А. Пальцев, Н. М. Аничков. М.: Медицина, 2000. Т.1.- 528 с.
- Пирс Э. Гистохимия. Теоретическая и прикладная. ИИЛ, М., 1962.962 с.
- Сайфитдинова, А.Ф. Двумерная флуоресцентная микроскопия для анализа биологических образцов: Учебно-методическое пособие / А. Ф. Сайфитдинова. СПб: СОЛО, 2008. — 72 с.
- Феофанов, А. В. Спектральная лазерная сканирующая конфокальная микроскопия в биологических исследованиях / А. В. Феофанов // Успехи биологической химии, т. 47. -2007. -С. 371−410.
- Черницкий, Е.А. Спектральный люминесцентный анализ в медицине / Е. А. Черницкая, Е. И. Слобожанина. Минск: Наука и техника, 1989. -146 с.
- Шерстнев, К.Б. Люминесцентный анализ в медицине и биологии и его аппаратурное обеспечение / К. Б. Шерстнев, Н. П. Милютина, В. В. Эстрин // Тез. докл. Рига: РМИ. — 1985. — С. 102−103.
- Akers W. A molecular rotor as viscosity sensor in aqueous colloid solutions / Akers W., Haidekker M.A. // Journal of Biomechanical Engineering., 2004. V. 126, P. 340−345
- Arredondo, M. Regulation of copper uptake and transport in intestinal cell monolayers by acute and chronic copper exposure / M. Arredondo, R. Uauy, M. Gonzalez // Biochimica et Biophysica Acta (BBA) General Subjects. -2000. -V. 1474. P. 169−176.
- Basu, M. Studies on the binding of l-anilino-8-naphthalene sulfonate to very low density and high density human serum lipoproteins / M. Basu, J. Tinkelstein, S. Ghosh, J. Schudics // Biochim. et biophys. Acta. 1975. — V. 398. P. 385.
- Becker, B.E., Gard, D.L. Visualization of the cytoskeleton in Xenopusoocytes and eggs by confocal immunofluorescence microscopy. / B.E. Becker,
- D.L. Gard. // Methods Mol. Biol. 2006, V. 322, P. 69−86.90
- Belov, V. N. Rhodamines NN: a novel class of caged fluorescent dyes / Belov V.N., Wurm C.A., Boyarskiy V.P. // Angew. Chem. Int. Ed., 2010. V. 49. P. 3520−3523.
- Belov, V. N. Rhodamine spiroamides for multicolor single-molecule switching fluorescent nanoscopy. / V.N. Belov, M.L. Bossi, J. Foiling, V.P. Boyarskiy, S.W. Hell, Chem.-Eur. J. 2009, V. 15, 10 762−10 776.
- Betzig, E., Patterson, G.H., Sougrat, R., Lindwasser, O.W., Olenych, S., Bonifacino, J.S., Davidson, M.W., Lippincott-Schwartz, J., and H.F. Hess. (2006) Imaging intracellular fluorescent proteins at nanometer resolution. Science V. 313 P. 1642−1645
- Boyarskiy V.P. Photostable, amino reactive and water-soluble fluorescent labels based on sulfonated rhodamine with a rigidized xanthene fragment at al / V.P. Boyarskiy, V.N. Belov, R. Medda // Chem. Eur. J., 2008. V. 49. P. 1784−1792.
- Chalfie, M., Tu, Y., Euskirchen, G., Ward, W.W., Prasher, D.C. Green fluorescent protein as a marker for gene expression. / M. Chalfie, G. Euskirchen,, W.W. Ward, D.C. Prasher,. // Science, 1994. V. 263. P. 802−805.
- Damyanov, I. / I. Damyanov, J. Linder // Anderson’s Pathology. 2000. — V.2. P.2095.
- Davis, J. N. Anterograde and transcellular transport of a fluorescent dye, bisbenzimide, in the rat visual system / J. N. Davis, N. Patterson, N. McKinnon // Neuroscience Letters. 1982. — V.29. P. 207−212.
- Drabikowski, W. Filipin as a fluorescent probe for the location of cholesterol in the membranes of fragmented sarcoplasmic reticulum / W. Drabikowski, E. Lagwiaska, M. Sarzala // Biochim. et biophis. acta. 1973. V.291.P. 61.
- Egner, A. Fluorescence microscopy with super-resolved optical sections. / A. Egner, S.W. Hell. // Trends Cell Biol. 2005. V. 15. P. 207−215.
- Evanko D. Primer: fluorescence imaging under the diffraction limit / D. Evanko // Nature Methods. 2009. V. 6. P. 19−20.
- Furuno, T. Live cell imaging to study signaling molecules in allergic reactions. / T. Furuno, M. Nakanishi. // Biol. Pharm. Bull. 2005. V. 28(9), P. 15 511 559.
- Grabowski, Z.R. Slructural changes accompanying intramolecular electron transfer Focus on twisted intramolecular charge-iransfcr stales and structures. / Z.R. Grabowski, K. Rotkiewicz, W. Rettig. // Chem. Rev. 2003. V. 103. P. 3899−4031.
- Hakanson R. Amine Mechanisms in Enterochromaffin and Enterochromaffin-Like Cells of Gastric Mucosa in Various Mammals. / R. Hakanson, C. Owman, N.O. Sjoberg, B. Sporrong // Histochemie. 1970. V. 21, P. 189−220.
- Heilemann M. Photos witches: Key molecules for subdiffraction-resolution fluorescence imaging and molecular quantification. / M. Heilemann, P. Dedecker, J. Hofkens, M. Sauer // Laser Photonics Rev. 2009, V. 3, P. 180−202.
- Hell S.W. Far-field optical nanoscopy. / S.W. Hell // Science 2007. V. 316, P. 1153−1158-
- Hell S.W., Microscopy and its focal switch. / S.W. Hell // Nature Methods 2009, V. 6, P. 24−32-
- Hermanson, G.T. Bioconjugate techniques. / G.T. Hermanson // Academic Press, Elsevier. 1996. — P. 272−274.
- Hess, S.T., T.P. Girirajan, and M.D. Mason. 2006. Ultra-high resolution imaging by fluorescence photoactivation localization microscopy. Biophys J. 91(11): 4258−4272.
- Juskaitis, R., A method for characterizing longitudinal chromatic aberration of microscope objectives using a confocal optical system / R. Juskaitis, T. Wilson // J. Microscopy. 1999. — V. 195. P. 17−22.
- Kirmse, W. 100 Years of the Wolff Rearrangement. / W. Kirmse // Eur. J. Org. Chem. 2002. — P. 2193−2256.
- Krause G.H., Chlorophyll fluorescence and photosynthesis: The basics / G.H. Krause, E. Weis // Annu. Rev. Plant. Physiol. Plant. Mol. Biol. 1991. -V. 42. P. 313−349.
- Lakowicz, J.R. Principles of Fluorescence Spectroscopy. /
- J.R. Lakowicz. New York: Springer 2006. 954 p.93
- Lidke, D.S. Caught in the Act: Quantifying Protein Behavior in Living Cells / D.S. Lidke, B.S. Wilson // Trends Cell Biol. 2009. — V. 11. P. 566−574.
- Lippincott-Schwartz, J. Studying protein dynamics in living cells / J. Lippincott-Schwartz, E. Snapp, A. Kenworthy // Nat. Rev. Mol. Cell Biol. -2001.-V. 2 P. 444−456.
- Lippincott-Schwartz J. Putting super-resolution fluorescence microscopy to work. / J. Lippincott-Schwartz, S. Manley. // Nature Methods 2009. V. 6. P. 2123.
- Moerner, W. E. New Directions in Single-Molecule Imaging and Analysis / W.E. Moerner // Invited Perspective, Proc. Nat. Acad. Sci. 2007. -V. 104. P. 12 596−12 602.
- Moerner, W.E. Single-molecule mountains yield nanoscale cell images / W.E. Moerner // Nature Methods 2006. — V. 3. P. 781−782.
- Molho, J.I. Optimization of Turn Geometries for Microchip Electrophoresis. / J.I. Molho, A.E. Herr, B.P. Mosier, J.G. Santiago, T.W. Kenny,
- R.A. Brennen, G. Gordon, B. Mohammadi // Anal. Chem. 2001. — V. 73. P. 1350−1360.
- Murray, J.M. Confocal microscopy, deconvolution, and structured illumination methods. / J.M. Murray // Live Cell Imaging-A Laboratory Manual (Gold- man, R.D., Spector, D.L., eds.) Press, Cold Spring Harbor, New York. -2005. P. 239−279.
- Neher R.A. Blind source separation techniques for the decomposition of multiply labeled fluorescence images. / Mitkovski M., Kirchhoff F., Neher E., Theis F. J, Zeug A. // Biophys. J, 2009. V.96, P. 3791−3800.
- Paddock, S. Confocal Microscopy Methods and Protocols / N.J. Totowa: Humana Press Inc. 1999. V. 122, 446 p.
- Patterson G.H. Use of the Green Fluorescent Protein and its mutants in quantitative fluorescence microscopy / G.H. Patterson, S.M. Knobel, W.D. Sharif, S.R. Kain, D. W Piston // Biophysical Journal. 1997. — V. 73. P. 2782−2790.
- Piston, D.W. Imaging living cells and tissues by two-photon excitation microscopy / D.W. Piston // Trends Cell Biol. 1999 — V. 9 P. 66−69.
- Politz J. C. Use of caged fluorochromes to track macromolecular movement in living cells/ J. C. Politz // Cell Biologyl999. V9, P. 284 287.
- Rust, M. J, Sub-diffraction-limit imaging by stochastic optical reconstruction microscopy (STORM) / M.J. Rust, M. Bates, X. Zhuang // Nature Methods. 2006. — V.3, P. 793−795.
- Shinitzky, M. Difference in microviscosity induced by different cholesterol levels in the surface membrane lipid layer of normal lymphocytes and malignant lymphoma cells / M. Shinitzky, M. Inbar // J. Mol. Biol. 1974. V. 85. P. 603.
- Snare, M. J. The photophysics of rhodamine B / M. J. Snare, F. E. Treloar, K. P. Ghiggino, P. J. Thistlethwaite // Journal of Photochemistry, 1982, Vol 18, P. 335−346.
- Transidico, P. Probing photonic and optoelectronic structures by apertureless scanning near-field optical microscopy / P. Transidico, M. Bianchi, M. Carpa, P.G. Pelicci, M. Faretta. / Microsc. Res. Tech. 2004, V. 64. P89−95.
- Tsien R.Y., The Green Fluorescent Protein. /R.Y. Tsien. Annual Review of Biochemisty 1998. V.67, P. 509−544
- Vanderkooi, J.M. Interaction of general anesthetics with phospholipid vesicles and biological membranes/ J. M. Vanderkooi, R. Landesberg, I.H. Selick, G.G. McDonald // Biochim. et biophis. acta. 1977. — V. 464. P.l.
- Wildanger, D. and, A STED microscope aligned by design. / D. Wildanger, D.J. Buckers, V. Westphal S.W. Hell L. Kastrup // Opt. Express. -2009. V. 17(18). P. 16 100−16 110
- Willets, K.A. Experimental and Theoretical Investigations of Environmentally Sensitive Single-Molecule Fluorophores / K.A. Willets, Patrik R. Callis, W. E. Moerner // J. Phys. Chem, 2004, Vol 108, P. 10 465−10 473.
- Willis, R.C. Portraits of Life: One Molecule at a Time. / R.C. Willis I I Anal. Chem. 2007. — V. 79. P. 1785−1788.
- Декан вече ри н ар 11 о -б и ол 01 и чес ко то факульчета. профессор
- Зав. кафедрой химии имени профессоров С. И. Афонскою. А. Г. Малахова профессор
- Профессор кафедры химии имени профессоров С. И. Афонского, А. Г. Малахова профессор1. Ярыгина к. И.1. Лысенко 11.11.1. Зайцев С Ю.1. Царькова М.С.