Гетерогенность свойств основных РНК-компонентов белоксинтезирующей системы клетки в связи с биологическими особенностями зерновых культур
Диссертация
Апробация работы. Материалы диссертации были представлены на: Всероссийской конференции «Роль биотехнологии в экологизации природной среды, питания и здоровья человека» (Ставрополь, 2001), Международном симпозиуме «Plant under environmental stress» (Москва, 2001), III съезде биохимического общества (Санкт-Петербург, 2002), IV и V региональной научно-практической конференции молодых учёных… Читать ещё >
Список литературы
- Бердинских, Н.К. Белоксинтезирующий аппарат клеток при опухолевом росте / Н. К. Бердинских. Киев: Наукова думка, 1983. — 176 с.
- ГОСТ 30 502–97. Корма, комбикорма, комбикормовое сырьё (атомно-адсорбционный метод определения содержания магния. — Введ. 1999−01 — 01. Минск: ИПК: Изд-во стандартов, 1998. — 6 с.
- Гродзинский, Д.М. Системы надёжности растительных организмов / Д. М. Гродзинский. Киев: Наукова думка, 1977. — 367 с.
- Досон, Р. Справочник биохимика / Р. Досон и др. М.: Мир, 1991. — 543с.
- Доспехов, Б.А. Методика полевого опыта (С основами статистической обработки результатов исследований) / Б. А. Доспехов. — М.: Колос, 1979. -416 с.
- Дэвидсон, Э. Дествие генов в раннем развитии / Э. Дэвидсон- перевод с англ. А. И. Борисова, Б. Н. Евгеньева. М.: Мир, 1972. — 342 с.
- Зенгер, В. Принципы структурной организации нуклеиновых кислот / В. Зенгер. М.: Мир, 1987. — 584 С.
- Зерно. Методы анализа.- М.: ИПК Издательство стандартов, 2004. 132с.
- Ивлев, A.M. Биогеохимия / A.M. Ивлев М.: Высшая школа, 1986. -127с.
- Кантор, Ч. Биофизическая химия / Ч. Кантор, П. Шиммел. — М.: Мир, 1984. Т. 1. 336с., Т. 3.- 536с.
- Кефели, В.И. Физиологические основы конструирования габитуса растений / В. И. Кефели. М.: Наука, 1994. — 269с. '
- Коничев, А.С. Молекулярная биология: учеб. для студ. пед. вузов / А. С. Коничев, Г. А. Севастьянова. — М.: Издательский центр «Академия», 2003. -400 с.
- Кочетков, Н.К. Органическая химия нуклеиновых кислот / Н. К. Кочетков и др. М.: Химия, 1970. — 716 с.
- Маниатис, Т. Молекулярное клонирование / Т. Маниатис, Э. Фрич, Дж. Сэмбрук. М.: Мир, 1984. — 480с.
- Минеев, В.Г. Агрохимия / В. Г. Минеев. М.: МГУ, 1990. — 486с.
- Мушкабаров, Н.Н. Молекулярная биология: учеб. для студ. мед. вузов / Н. Н. Мушкабаров, C.JI. Кузнецов. М. ЮОО «Медицинское информационное агенство», 2003. — 544с.: ил.
- Ненько, Н.И. Действие на растения регуляторов роста, синтезированных на основе фурфурола / Ненько Наталья Ивановна: автореф. дис. на сосиск. степени докт. биол. наук. Краснодар, Кубанский агроуниверситет, 1999. -52с.
- Осборн, Т. Б. Растительные белки / Т. Б. Осборн. M.-JL, 1935. — 220с.
- Остерман, JI.A. Исследование биологических макромолекул электрофокусированием, иммуноэлектрофорезом и радиоизотопным методами / Л. А. Остерман. -М.: Наука, 1983. 304с.
- Остерман, Л.А. Хроматография нуклеиновых кислот / Л. А. Остерман. — М.: Наука, 1985.-536с.
- Патрушев, Л.И. Экспрессия генов / Л. И. Патрушев. М.- Наука, 2000. -527 с.
- Питерман, М. Физические и химические свойства рибосом / М. Питер-ман. М.: Мир. 1967. — 304 с.
- Полевой, В.В. Физиология растений / В. В. Полевой. М.: Высшая школа, 1989. — 464с.
- Спирин, А.С. Рибосома / А. С. Спирин, Л. П. Гаврилова. М.: Наука. 1971.-254 с.
- Спирин, А.С. Молекулярная биология: структура рибосом и биосинтез белка / А. С. Спирин. М.: Высшая школа, 1986. — 303.
- Тарчевский, И.А. Метаболизм растений при стрессе / И. А. Тарчевский. -Казань: Фэн, 2001. 447с.
- Фадеева, В.И. Основы аналитической химии / И. В. Фадеева и др.- под ред. Ю. А. Золотов -М.: Высш. шк., 2001. 463 с.
- Федулов, Ю.П. Системный анализ морозоустойчивости озимых культур / Федулов Юрий Петрович: автореф. дис. на соиск. степени док. биол. наук. Санкт-Петербург, 1994. — С.45.
- Шахов, А.А. Фотоэнергетика растений и урожай / А. А. Шахов. — М.: Наука, 1993.-411с.
- Шевелуха, B.C. Рост растений и его регуляция в онтогенезе / B.C. Шеве-луха. -М.: Колос, 1992. 594с.
- Шеуджен, А.Х. Магниевое питание риса и эффективность применения магниевых удобрений / А. Х. Шеуджен, В. В. Прокопенко. Краснодар. 1999.-С. 98
- Шеуджен, А.Х. Биогеохимия / А. Х. Шеуджен. Майкоп: ГУРИПП «Адыгея», 2003. — 1028 с.
- Алёшин, Е.П. Содержание и вынос элементов минерального питания рисом / Е. П. Алёшин, М. М. Щукин, А. Х. Шеуджен // Агрохимия. 1986. -№ 9. — С. 82−87.
- Аравин, А.А. Роль двухцепочечной РНК в подавлении экспрессии генов эукариот / А. А. Аравин и др. // Молекулярная биология. 2002. — Т. 36. -С. 240- 251.
- Арион, В.Я. Обнаружение «скрытых» рибонуклеаз в высокоочищенных препаратах РНК / В. Я. Арион и др. // Молекулярная биология. 1982. -Т.16.-№ 1.-С.201−209.
- Бакалдина, Н.Б. Холодоиндуцированные изменения стабильности мРНК субъединицы альфа фактора элонгации трансляции 1 у проростков пшеницы и ячменя / Н. Б. Бакалдина, Ж. В. Алексеенко, В. К. Плотников // Физиология растений. 2001. — Т. 48, № 6. — 1−7.
- Баршевская, Т.Н. Неспецифическая деградация РНК в присутствии ионов магния / Т. Н. Баршевская, JI.E. Горюнова, Р. Ш. Бибилашвили // Молекулярная биология. 1987. — Т. 21. — № 5. — С. 1235−1241.
- Батыгин, Н.Ф. К вопросу о теории зимостойкости и построении модели сорта / Н. Ф. Батыгин // Повышение зимостойкости озимых зерновых: под. ред. B.C. Шевелуха. М.: Колос, 1993. — С. 14−22.
- Бекман, Э.М. Автолитическая деградация РНК: влияние различных факторов на динамику процессов / Э. М. Бекман и др. // Молекулярная биология. 1986. — Т. 20. — № 2. — С. 527 — 538.
- Богатырев, В.А. Оптические свойства конъюгатов коллоидного золота с олиготимидином и их изменение при реакции гибридизации с полиадени-ловой кислотой / В. А. Богатырев и др. // Коллоидный журнал. 2005. — Т. 67. — № 4. — С. 458−468.
- Бучаченко, A.JI. Магнитный изотопный эффект магния ключ к механо-химии фосфорилирующих ферментов как молекулярных машин / A.JI. Бучаченко, Д. А. Кузнецов // Молекулярная биология. — 2006. — Т. 40. — С. 1219.
- Власов, В.В. Химические рибонуклеазы / В. В. Власов и др. // Молекулярная биология. 1998. — Т. 32. — С. 62−70.
- Воронина, А.С. Регуляция на уровне трансляции в раннем развитии эукариот / А. С. Воронина // Молекулярная биология. 2002. — Т.36, № 6. — С. 956−969.
- Доукинс, Р. Опасна ли генная инженерия? / Р. Доукинс // Современная биотехнология. Мифы и реальность. М.: Тайдекс Ко, 2004. — С. 162−164.
- Евтеева, И. Н. 2000. Новая эндорибонуклеазная активность 26S протеасом из клеток линии А431 / И. Н. Евтеева и др. // Цитология. Т. 42. — № 7. — С. 675—680.
- Ельская, А.В. Регуляция белкового синтеза у высших организмов / А. В. Ельская //Молекулярная биология. 1999. — Т. 33. — С. 1043.
- Зарудная, М.И. Исследование конформационных переходов в поли(А) методом буферной ёмкости / М. И. Зарудная // Молекулярная биология. -1998. Т. 32. — № 3. — С. 508−514.
- Зарудная, М. И. Полиаденилирование про-мРНК. 2. Образование 3'-концевых поли (А)-последовательностей мРНК дрожжей, растений, прокариотов и вирусов / М. И. Зарудная // Бюполимепи i клггка. 2001. — Т. 17. -№ 2. — С. 40 — 55
- Кораблева, Н Фракционный состав белков пшеницы, культивируемой в Узбекистане / Н. Кораблева и др. // Хлебопродукты. 2004. — № 3. — С. 3132.
- Крицкий, М.С. Коферменты и эволюция мира РНК / М. С. Крицкий, Т. А. Телегина // Успехи современной биологии. 2004. — Т. 44. — С. 341−364.
- Клячко, H.JI. Матричные РЕЙС и трансляционный контроль в растениях / H.JI. Клячко // Физиол. и биохим. культурных растений. 1991. — Т. 23. — С. 419−426.
- Клёнов, М.С. Формирование гетерохроматина: роль коротких РНК и метилирования ДНК / М. С. Клёнов, В. А. Гвоздев // Биохимия. 2005. — Т.70. -Вып. 11.-С. 1445−1458.
- Кузнецов, В.В. РНК-интерференция. Использование метода для создания нокаутных организмов и клеточных линий / В. В. Кузнецов // Биохимия. — 2003. Т. 68. — Вып. 10. — С. 1301−1317.
- Кузьмин, А.Н. Роль магния в питании растений и влияние его на урожай сельскохозяйственных культур / А. Н. Кузьмин // Сельское хозяйство за рубежом. Растениеводство. 1974. — № 5. — С. 14−16.
- Куличкова, В.А. Специфические ДНК-связывающая и эндорибонуклеаз-ная фктивности прочно связанных с хроматином малых РНП / В. А. Куличкова // Молекулярная биология. — 1999. — Т. 33, № 5. — С. 764−771.
- Макарова, Ю.А. Некодирующие РНК / Ю. А. Макарова, Д. А. Крамеров // Биохимия. 2007. — Т. 72. — № 11. — С. 1427 — 1447.
- Овчинников, JI.A. Мажорные белки мРНП в структурной организации функционировании мРНК в клетках эукариот / JI.A. Овчинников и др. // Молекулярная биология. 2001. — Т. 35. — С. 548−558.
- Осборн, Д. Дж. Нуклеиновые кислоты и прорастание семян / Д. Дж. Ос-борн // Физиология и биохимия покоя и прорастания семян: под. ред. М. Г. Николаевой, Н. В. Обручевой. М.: Колос, 1982. — С. 357−372.
- Пахомова, В.М. Основные положения современной теории стресса и ниспецифический адаптационный синдром у растений / В. М. Пахомова // Цитология. 1995. — Т. 37. — С. 66−91.
- Пильщикова, Н.В. Минеральное питание растений / Н. В. Пилыцикова // Физиология и биохимия сельскохозяйственных растений. 1998. — С. 280 345.
- Плотников, В.К. Стабильность мРНК как фактор регуляции экспрессии генов в клетках эукариот / В. К. Плотников // Успехи современной биологии. 1992. — Т.112. — Вып.2. — С.186−197.
- Плотников, В.К. Способ диагностики физиологического состояния зерновых культур / В. К. Плотников, Н. Б. Бакалдина, В. А. Бибишев // Патент РФ № 2 084 133 от 20.07.1997.
- Плотников, В.К. Сорт озимой пшеницы «Краснодарская-39» — источник открытий в молекулярной биологии растений / В. К. Плотников // Пшеница и тритикале: сб. науч. тр. (поев. 100-летию акад. П.П.Лукьяненко) / КНИ-ИСХ. Краснодар, 2001. — С. 611−616.
- Плотников, В.К. Генетико-физиологическая детерминация распада мРНК злаков in vitro / В. К. Плотников // Успехи современной биологии. -2003.-Т. 123.-С. 98−109.
- Плотников, В.К. Регуляция синтеза белка в клетках эукариот на уровне стабильности мРНК / В. К. Плотников // Аминокислотное питание животных и проблема белковых ресурсов: сб. ст. по материалам конф. Краснодар, 2005.-С. 313−335.
- Плотников, В.К. Генетический контроль и экологическая обусловленность стабильности мРНК в клетках эукариот / В. К. Плотников // Изв. Тимирязевской сельскохозяйственной академии. 2007. — № 5. — С. 110−119.
- Плотников, В.К. Закономерный распад РНК in vivo и in vitro основа новых методов биотехнологии / В. К. Плотников // Наука Кубани. — 2007. — № 4.-С. 4- 15.
- Полежаев, С.Л. Влияние качества аминокислотного питания на стабильность мРНК животных / С. Л. Полежаев // Проблемы повышения качества зерна пшеницы и других зерновых культур: сб. науч. тр. РАСХН. — М., 1998.-С. 248−255.
- Попов, А.К. Использование хроматографии на колонке с поли(У)-целлюлозой для выделения эукариотической матричной РНК / А. К. Попов, А. Р. Федотов, Г. А. Дворкин // Биохимия. 1975. — Т. 40. — С. 45−47.
- Пыльнева, П.Н. Особенности качественного состава золы высоколизиновой кукурузы / П. Н. Пыльнева // Физиология и биохимия культурныхрастений. 1976. — Т. 8. — Вып. 1. — С. 77−82.
- Рибонуклеиновый год (в 2006 году сразу две Нобелевские премии присуждены за работы, объектом которых была рибонуклеиновая кислота -РНК). Электронный ресурс. / электронная газета: режим доступа: .http://www.stengazeta.net/article.html?article=2705.
- Рядчиков, В.Г. Обмен веществ, рост белых крыс и поросят при балансе и имбалансе аминокислот / В. Г. Рядчиков, В. К. Плотников, А. В. Плотникова // Производство и использование растительного белка: Всесоюз. совещ., Краснодар, 1981. С. 216−217.
- Рядчиков, В.Г. Баланс аминокислот как регулятор аппетита и синтеза белка у свиней / В. Г. Рядчиков, В. К. Плотников, А. В. Плотникова // Сб. науч. тр. КНИИСХ им. Лукьяненко и СКНИИЖ, 1986. С. 57−63.
- Спирин, А.С. Биосинтез белков, мир РНК и происхождение жизни / А. С. Спирин // Вестник Российской академии наук. 2001. — Т. 71. — С. 320−328.
- Спирин, А.С. Рибонуклеиновые кислоты как центральное звено живой материи / А. С. Спирин // Вестник Российской академии наук. 2003. — Т. 73.-С. 117−127.
- Спирин, А.С. Мир РНК и его эволюция / А. С. Спирин // Молекулярная биология. 2005. — Т. 39. — № 4. — С. 550−556.
- Телегина, Т.А. Влияние ионов магния и излучения в линиях магния на транскрипционную активность нуклеоидов хлоропластов папоротника Azolla pinnata R.Br. / Т. А. Телегина, М. С. Турищева // Прикладная биохимия и микробиология. 1994. — Т. 30. — С. 292−297.
- Тимофеева, А.В. Метод количественного анализа короткоживущих РНК и продуктов их распада с помощью обратной транскрипции и полимераз-ной цепной реакции / А. В. Тимофеева и др. // Молекулярная биология. -2000.-Т. 34. № 1. — С. 79−86.
- Толкачёва, Т.В. Роль G-белков в специфичности клеточного ответа: особенности строения и функционирования а-субъединицы / Т. В. Толкачёва и др. //Молекулярная биология. 1996. — Т. 30. — С. 1002−1014.
- Трифонова, Е.А. Роль нуклеаз в физиологических процессах высших растений / Е. А. Трифонова, А. В. Кочетов, В. К. Шумный // Успехи современной биологии. 2000. — Т. 120. — С. 395−405.
- Трудолюбова, М.Г. Количественное определение РНК и ДНК в субклеточных фракциях клеток животных / М. Г. Трудолюбова // Современные методы биохимии: под ред. Ореховича. М.: Медицина, 1977. — С. 313 -319.
- Трунова, Т.Н. Рост и морозостойкость растений / Т. Н. Трунова, Г. В. Кузина, М. А Бочарова // Рост и устойчивость растений. Новосибирск: Наука, 1988. — С. 133−144.
- Фещенко, В.В. Влияние системы генов ppd на рост и развитие апикальной меристемы и молодых листьев у пшеницы разных биотипов /В.В. Фещенко и др. // Биол. науки. 1992. — № 6. — С. 44−51.
- Хаитов, М.Р. Интерференция РНК / М. Р. Хаитов, B.C. Акимов //Успехи современной биологии. 2006. — Т. 126. — № 3. — С. 242−249.
- Четверин, А.Б. Новоый взгляд на рекомбинацию РНК / А. Б. Четверин // Молекулярная биология. 1996. — Т. 33. — С. 985−996.
- Чирков, Г. П. Деградация 18 S и 288-рибосомных РНК в цитоплазме клеток печени крыс при подавлении синтеза белков / Г. П. Чирков и др. // Биохимия. 1983. — Т.48. — С. 1157−1162.
- Belasco, J. Control of messenger RNA stability / J. Belasco, G. Brawerman (eds) New York.: Academic Press, 1993. 500 P.
- Marschner, H. Mineral nutrition in higher plants / H. Marschner. San Diego.: Academic Press, 1995. — 887 p.
- Abler, M.L. Control of mRNA stability in higher plants / M.L. Abler, P.J. Green // Plant Mol.Blol. 1996. — V.32. — P.63−78.
- Ajtkhozhin, M.A. lnformosomes as a stored form of mRNA in wheat embryos / M.A. Ajtkhozhin, K.J. Doschanov, A J. Akhanov // FEBS Lett. 1976. — V. 66 -P. 124−126.
- Amara, J. F. Specific mRNA destabilization in Dictyostelium discoideumrequires RNA synthesis / J. F. Amara and H. F. Lodish // Mol. Cell. Biol. -1987. V. 7, № 12. — P. 4585−4588.
- Anand, A. Stable trasgene expression and random gene silencing in wheat / A. Anand, H.N. Trick, B.S. Gil // Plant Biothechnol. J. 2003. — V. l, № 4. — P.241−251.
- Anderson, M.A. Sequence variability of three alleles of the self-incopability gene of Nicotiana alata / M.A. Anderson et al. // Plant Cell. 1989. — V. l, № 4. — P.483−491.
- Arruda, P. Regulation of lysine catabolism in higher plants / P. Arruda // Trends in Plant Sciens. 2000. — V. 5. — P. 324−330.
- Aviv, H. Purification of biogically active globin messenger RNA by chromatography on oligothymidilic acid-cellulose / H. Aviv, P. Leder // Proc. Nat. Acad. Sci. U.S.A. 1972. — V. 69. — P. 1408−1412.
- Bahar, B. Long-term stability of RNA in post-mortem bovine skeletal muscle, liver and subcutaneous adipose tissues / B. Bahar et al. // BMC Molecular Biology. 2007. — V. 8. — P. 108−120.
- Baker, E.Y. Control of poly (A) length /E.Y. Baker // Control of mRNA stability: Belasco J.G., Brawerman G. eds. San Diego, CA: Academic Press, N.Y., 1993. — P.367−415.
- Banatao, D.R. Microenvironment analysis and identification of magnesium binding sites in RNA / D.R. Banatao, R.B. Altman, Т.Е. Klein // Nucleic Acids Res. 2003. — V. 31. — P. 4450−4460.
- Bandyopadhyay, R. Nuclease activity associated with mRNA in its native stage: possible basis selectivity in mRNA decay / R. Bandyopadhy et al. // Mol. and Cell. Biol. 1990. — V. 10. — P. 2060−2065.
- Bandyopadhyay, R. Secondary structure at the beginning of the poly (A) sequence of mouse P-actin messenger RNA / R. Bandyopadhyay, G. Brawerman // Biochimie. 1992. — V. 74. — P. 1031−1034.
- Banerjee, S. RNase L-independent specific 28S rRNA cleavage in murine coronavirus infected cells / S. Banerjee et al. // J. Virol. 2000. — V. 74. — P.8793−8802.
- Bardwell, J. С. Autoregulation of RNase III operon by mRNA processing / J. C. Bardwell et al. // EMBO J. 1989. — V. 8. — P. 3401−3407.
- Bariola, P.A. The Arabidopsis ribonuclease gene RNS1 is tightly controlled in response to phosphate limitation / P.A. Bariola et al. // Plant J. 1994. — V. 6. -P. 673−685.
- Bariola, P.A. Plant ribonucleases / P.A. Bariola, P.J. Green // Ribonucleases: structure and function: eds G.D. Alessio, J.F. Riordan. New York: Academic Press, 1997.-P. 163−190.
- Bariola, P.A. Regulation of S-like ribonuclease levels in Arabidopsis. Antisense inhibition of RNS1 or RNS2 elevates anthocyanin accumulation / P.A. Bariola, G.C. Macintosh, P.J. Green // Plant Physiol. 1999. — V. 119. — P. 331−342.
- Belanger, F. Heat shock causes destabilization of specific mRNAs and destruction of endoplasmic reticulum in barley aleurone cells / F. Belanger, M. Brodl, T. Ho //Proc. Nat. Acad. Sci. U.S.A. 1986. — V. 83. — P. 1354.
- Belasco, J.G. Mechanisms of mRNA decay in bacteria: a perspective / J.G. Belasco, C.F. Higgins // Gene. 1988. — V. 72. — P. 15−23.
- Beelman, C.A. Degradation of mRNA in eukaryotes / C.A. Beelman, R. Parker //Cell.- 1995. -V. 81.-P. 179−183.
- Belostotsky, D.A. Differential organ-specific expression of three poly (A) binding protein genes from Arabidopsis thaliana / D.A. Belostotsky, R.B. Meagher// Proc. Natl. Acad. Sol. USA. 1993. — V.90. — P.6686−6690.
- Beran, R.K. Cold temperature induction of Escherichia coli polynucleotide phosphorylase occurs by reversal of its autoregulation / R.K. Beran, R.W. Simons // Mol. Microbiol. 2001. — V. 39. — P. 112−125.
- Bernstein, Ph. The pole (A)-binding protein complex is a major determinant of mRNA stability in vitro / Ph. Bernstein, S. Peltz, J. Ross // Mol. and Cell. Biol. 1989.-V. 9.-P. 6589.
- Bessarab, D.A. RNA components of Escherichia coli degradosome: evidencefor rRNA decay / D.A. Bessarab et al. // Proc. Natl Acad. Sci. USA. 1998. -V. 95.-P. 3157−3161.
- Bewley, J.D. Seed germination and dormancy / J.D. Bewley // Plant Cell. -1997.-V. 9.-P. 1055−1066.
- Biggiogera, M. Rearrangement of nuclear ribonucleoprotein (RNP)-containing structures during apoptosis and transcriptional arrest / M. Biggiogera //Biology of the Cell. 2004. — V. 96. — P. 603−615.
- Brawerman, G. The role of the poly (A) sequence in mammalian messenger RNA / G. Brawerman // Critical Reviews in Biochemistry. 1981. — V. 10. — P. 1−38.
- Brawerman, G. Determinants of messenger stability / G. Brawerman // Cell. -1987.-V. 48.-P. 5−10.
- Brawerman, G. mRNA decay: finding the right targets / G. Brawerman // Cell. 1989. -V. 57.-P. 9−10.
- Brawerman, G. mRNA degradation in eukaryotic cells: an overview / G. Brawerman // In control of mRNA stability: eds. J.G.Belasco, G. Brawerman. -San Diego, CA: Academic Press, N. Y., 1993. P. 149−159.
- Brannvall, M. Metal ion cooperativity in ribozyme cleavage of RNA / M. Brannvall and L.A. Kirsebom // PNAS. 2001. — V. 98. — P. 12 943−12 947.
- Brewer, G. Regulation of c-myc mRNA stability in vitro by a labile destabilizer with an essential nucleic acid component / G. Brewer and J. Ross // Mol. Cell. Biol. 1989. — V. 9. — P. 1996−2003.
- Brewer, G. Characterization of c-myc 3'-5' mRNA decay activities in vivo an in vitro system / G. Brewer // J. Biol. Chem. 1998. — V. 273. — P. 34 770−34 774.
- Brocklehurst, P.A. Ribosomal RNA integrity and rate of seed germination / P.A. Brocklehurst, R.S. Fraser // Planta. 1980. — V. 148. — P. 417−421.
- Bushell, M. Translation inhibition during the induction of apoptosis: RNA or protein degradation? / M. Bushell et al. // Biochemical Society Transactions. -2004.-V. 4.-P. 606−610.
- Butler, J.S. RNA processing generates the mature 3'end of yest CYC1messenger RNA in vitro / J.S. Butler, T. Pratt // Scince. 1988. — V. 242. — P. 1270−1274.
- Byrne, D.H. Half-life of oat mRNAs in vivo and in polysome-based in vitro system / D.H. Byrne, K.A. Seeley, J.T. Colbert // Planta. 1993. — V.189. -P.149−156.
- Cai, C.Q. Nitric Oxide-Dependent Ribosomal RNA Cleavage Is Associated with Inhibition of Ribosomal Peptidyl Transferase Activity in ANA-1 Murine Macrophages / C.Q. Cai et al. // The Journal of Immunology. 2000. — V. 165.- P. 3978 -3984.
- Cairrao, F. Cold shock induction of RNase R and its role in the maturation of the quality control mediator SsrA/tmRNA / F. Cairrao et al. // Mol. Microbiol.- 2003. V. 50.-P. 1349−1360.
- Cannistraro, V.J. Specific endonucleolytic cleavage sites for decay of Escherichia coli mRNA / V.J. Cannistraro, M.N. Subbarao, D. Kennell // J. Mol. Biol. 1986. — V. 192. — P. 257−274.
- Cannistraro, V. J. Purification and characterization of ribonuclease M and mRNA degradation in Escherichia coli / V. J. Cannistraro, D. Kennell // Eur.J. Biol. 1989. — V. 181. — P. 363−378.
- Caplen, N.J. Specific inhibition of gene expression by small double-stranded RNAs in invertebrate and vertebrate systems / N.J. Caplen et al. // Proc. Natl. Acad. Sc.-2001.-V. 98-P. 9742−9747.
- Carpousis, A.J. mRNA degradation: a tale of poly (A) and multiprotein machines / A.J. Carpousis, N.F. Vanzo, L.C. Raynal // Trends in Genetics. -1999.-V. 15.-P. 24−28.
- Casey, J. L. Iron-responsiveelements: regulatory RNA sequences that control mRNA levels and translation / J. L. Casey et al. // Science. 1988. — V. 240.1. P. 924−940.
- Castelli, J.C. A study of the interferon antiviral mechanism: apoptosis activation by the 2−5A system / J.C. Castelli et al. // J. Exp. Med. 1997. — V. 186.-P. 967−72.
- Chanda, P. K. Cloning, sequence analysis, and expression of alteration of the mRNA stability gene (ams+) of Escherichia coli / P. K. Chanda et al. // J. Bacterid. 1985. — V.161, № l.-P. 446−449.
- Cech, T.R. In vitro splicing of the ribosomal RNA precursor of Tetrahymena-. involvement of guanosine nucleotide in the excision of the intervening sequence / T.R. Cech, A.J. Zaug, P.J. Grabowski //Cell. 1981. — V. 3. — P. 487−496.
- Cech, T.R. Ribozymes, the first 20 years / T.R. Cech // Biochem. Soc. Trans. -2001. V.30. -P.l 162−1166.
- Chekanova, J.A. Evidence that poly (A) binding protein has an evolutionarily conserved function in facilitating mRNA biogenesis end export / J.A. Chekanova, D.A. Belostotsky // RNA. 2003. — V. 9. — P. 1476−1490.
- Chen, C. Elevation of RNase R in response to multiple stress conditions / C. Chen, M.P. Deutscher // J. Biol. Chem. 2005. — V. 280. — P. 34 393−34 396.
- Cheng, Z.-F. Quality control of ribosomal RNA mediated by polynucleotide phosphorylase and RNase R / Z.-F. Cheng, M.P. Deutscher // Proc. Natl Acad. Sci. USA. 2003. — V. 100. — P. 6388−6393.
- Cheng, Z.-F. An important role for RNase R in mRNA decay / Z.-F. Cheng, M.P. Deutscher// Mol. Cell. 2005. — V. 17. — P. 313−318.
- Chetverin, A.B. On the nature of spontaneous RNA synthesis by Qp replicase / A.B. Chetverin, H.V. Chetverina, A.V. Munishkin // J. Mol. Biol. 1991. — V. 222.-P. 3−9.
- Chetverina, H.V. Cloning of RNA molecules in vitro / H.V. Chetverina, A.B. Chetverin //Nucleic Acids Res. 1993. — V. 21. — P. 2349−2353.
- Chicas, A. Characteristics of post-transcriptional gene silencing / A. Chicas, G. Macino // EMBO repots. 2001. — V. 2. — P. 992−996.
- Cole, P.E. Conformational changes of transfer ribonucleic acid. Equilibriumphase diagrams / P.E. Cole, S.K. Yangs, D.M. Crothers // Biochemistry. 1972. -V. 11.-P. 4358−4368.
- Colegrove-Otero, L.J. RNA-Binding Proteins in Early Development / L.J. Colegrove-Otero, N. Minshal, N. Standart // Critical Reviews in Biochemistry and Molecular Biology / Editor: Wickens M. 2005. — V. 40. — P. 21 — 73.
- Copois, V. Impact of RNA degradation on gene expression profiles: assessment of different methods to reliably determine RNA quality / V. Copois et al. // J. Biotech. 2006. — V. 8. — P. 259−270.
- Court, D. RNA processing and degradation by RNase III / D. Court // In control of mRNA stability: eds G. Brawerman, J.G. Belasko. — New York: Academic Press, 1993.-P. 70−116.
- Cowan, J.A. Structural and catalytic chemistry of magnesium-dependent enzymes / J.A. Cowan // BioMetals. 2002. — V. 15. — P. 225−235.
- Dantonel, J.-C. Transcription factor TFIID recruits factor CPSF for formation of 3' end of mRNA / J.-C. Dantonel et al. // Nature. 1997, (London). — V. 389.-P. 399102.
- Day, D.A. Post-transcriptional gene regulatory mechanisms in eukariotes: an overview / D.A. Day, M.F. Tuite // Jornal of Endocrinology. 1998. — V. 157. -P. 361−371.
- De Rocher, E.J. Direct evidence for rapid degradation of Bacillus thuringiensis toxin mRNA as a cause of poor expression in plant / E.J. De Rocher // Plant Physiol. 1998. — V. 117. — P. 1445−1461.
- Del Prete, M.J. Degradation of cellular mRNA is a general early apoptosis-induced event / M.J. Del Prete et al. // FASEB J. 2002. — V. 16. — P. 20 032 005.
- Deng, X.-W. The chloroplast genome exists in multimeric forms / X.-W. Deng, R. A. Wing, W. Gruissem // PNAS. 1989. — V. 86. — P 4156−4160.
- Deutch, C.E. Posttranscriptional regulation of a salt-inducible alfalfa gene encoding a putative chimeric proline-rich cell wall protein / C.E. Deutch, I. Winicov // Plant Mol. Biol.- 1995. V.27. — P. 411−418.
- Deutscher, M.P. Degradation of stable RNA in bacteria / M.P. Deutscher // J.Biol.Chem. 2003. — V.278. — P. 45 041−45 044.
- Deutscher, M.P. Degradation of RNA in bacteria: comparison of mRNA and stable RNA / M.P. Deutscher // Nucleic Acids Res. 2006. — V. 34. — P. 659 666.
- Diehn, S.H. Premature polyadenilation at multiple sites within a Bacillus thuringiensis toxin gene-coding region / S.H. Diehn et al. // Plant Physiol. -1998.-V. 117.-P. 1433−1443.
- Dickey, L.F. Light regulatory sequences are located within the 5' portion of the Fed-1 message sequence / L.F. Dickey, M. Gallo-Meagher, W.F. Thompson //EMBOJ. 1992. -V. 11.-P. 2311−2317.
- Dickey, L.F. Light modulation of ferredoxin mRNA abundance requires an open reading frame / Dickey, L.F. et al. // Plant Cell. 1994. — V. 6. — P. 11 711 176.
- Dilella, A.G. Degradation of 16S RNA in thermally injured Staphylococcus epidermis / A.G. Dilella, A.E. Sobota // Ohio Acad. Sci. 1980. — V. 80. — P. 813.
- Donovan, W.P. Polynucleotide phosphorylase and ribonuclease II are required for cell viability and mRNA turnover in Escherichia coli K-12 / W.P. Donovan, S.R. Kushner // Proc. Natl. Acad. Sci. USA. -.1986. V. 83. — P. 120−124.
- Draper, D.E. A guide to ions and RNA structure / D.E. Draper // RNA. 2004. -V. 10.-P. 335−343.
- Dreyfus, M. The poly (A) tail of mRNAs: bodyguard in eukaryotes, scavenger in bacteria / M. Dreyfus, P. Regnier // Cell. 2002. — V. l 11. — P. 611−613.
- Ebel, H. Magnesium metabolism / H. Ebel, T. Gunther // Journal of Clinical Chemistry and Clinical Biochemistry 1980. -V. 18. P. 257−270.
- Fialcowitz, E.J. A Hairpin-like Structure within an AU-rich mRNA-destabilizing Element Regulates trans-Factor Binding Selectivity and mRNA Decay Kinetics / E.J. Fialcowitz // J. Biol. Chem. 2005. — V. 280. — P. 22 406 -22 417.
- Fleischmann, J. Polyadenylation of ribosomal RNA by Candida albicans / J Fleischmann, H. Liu // Gene. 2001. — V. 265. — P. 71−76.
- Flavell, R.B. Inactivation of gene expression in plants as a consequence of specific sequence duplication / R.B.Flavell // Proc. Natl. Acad. Sci. USA. -1994. V. 91. — P. 3490−3496.
- Fu, P. Diffential expression of dehydrin in spring and winter cereals during cold acclimation / P. Fu et al. // Plant Physiol. 1994. — V. 105. P. 169−173.
- Fu, H. High-level tuber expression and sucrose inducibility of a potato Sus4 sucrose synthase gene require 5' and 3' flanking sequences and the leader intron / H. Fu, S. Y. Kim, W. D. Park // Plant Cell. 1995. — V.7. — P. 1387−1394.
- Fuchs, P. 18S rRNA degradation is not accompanied by altered rRNA transport at early times following irradiation of HeLa cell / P. Fuchs et al. // Radiation Research. 1990. — V. 121. — P. 67−70.
- Gallie, D.R. The cap and poly (A) tail of gene to regulation mRNA translational efficiency / D.R. Gallie // Genes Dev. 1991. — V. 5. — P. 21 082 116.
- Gallie, D.R. Posttranscrlptional regulation of gene expression in plants / D.R. Gallie // Annu. Rev. Plant Physiol. Mol. Biol. 1993. — V.44. — P.77−106.
- Gallie D. R Translational control of cellular and viral mRNAs / D.R. Gallie // Plant Mol. Biol.- 1996. V.32. — P. 145−158.
- Galili, G. Lysine catabolism: a stress and development super-regulated metabolic pathway / G. Galili et al. // Current Opinion in Plant Biology. -2001.-V. 4.-P. 261 -266.
- Gamier C. Heat-shock protein 90 (hsp90) binds in vitro to tubulin dimer and inhibits microtubule formation / C. Gamier et al. // Biochem. Biophys. Res. Commun. 1998. — V. 250. — P. 41419.
- Georgellis D. Decay of ompA mRNA and processing of 9S RNA are immediately affected by shifts in growth rate, but in opposite manners / D. Georgellis, S. Arvidson, and A. von Gabain // J. Bacteriol. 1992. — V.174. — P. 5382−5390.
- Gil, P. Characterization of the auxin-iducible SAUR-AC1 gene for use as a molecular genetic tool in Arabidopsis / P. Gil et al. // Plant Physiol. 1994. -V. 104.-P. 777−784.
- Gil, P. Multiple regions of the Arabidopsis SAUR-AC1 gene control transcript abudence: the 3 '-untranslation region functions as an mRNA instability determinant / P. Gil, P.J. Green // EMBO J. 1996. — V. 15. — P. 1678−1686.
- Gil, P. Regulatory activity exerted by the SAUR-AC1 promotor region in transgenic plants / P. Gil, P.J. Green // Plant Mol. Biol. 1997. — V. 34. — P. 803−808.
- Green, P.J. Control of mRNA stability in higher plants / P.J. Green //Plant Physiol. 1993. — V. 102. — P. 1065−1070.
- Green P.J. Control stability of mRNA in higher plants // Plant Mol. Biol. 1996. V. 32. P. 63−78.
- Halicka, H.D. Segregation of RNA and separate packaging of DNA and БУЧА in apoptotic bodies during apoptosis / H.D. Halicka, E. Bedner, Z. Darzynkiewicz // Exp Cell Res. 2000. — V. 260. — P. 248−256.
- Hammett, J.R. Storage and metabolism of poly (adenylic acid)-mRNA in germinating cotton seeds / J.R. Hammett, F.R. Katterman // Biochemistry. -1975. -V. 17. P. 3250−3256.
- Han, H. Mapping RNA regions in eukaiyotic ribosomes that are accessible to methidiumpropyl-EDTA z Fe (II) and EDTA z Fe (II) / Han, H. et al. //
- Biochemistry. 1994.-V. 33.-P. 9831−9844.
- Hautala, J.A. Increased expression of a eukaryotic gene in Escherichia coli through stabilization of its messenger RNA / J.A. Hautala et al. // Proc. Natl. Acad. Sci. U S A. 1979. — V.76, № 11. — P. 5774−5778.
- Henderson, I.R. Dissecting Arabidopsis thaliana DICER function in small RNA processing, gene silencing and DNA methylation pattering / I.R. Henderson et al. // Nature Genetics. 2006. — V. 38. — P. 721−725.
- Hentze, M. W. Homology between IRE-BP, a regulatory RNA-binding protein, aconitase, and isopropylmalate isomerase / M. W. Hentze, P. Argos // Nucleic Acids Res.-1991.-V. 19.-P. 1739−1740.
- Higgs, D.C. At phytochrome A mRNA degradation appears to occur via two distinct pathways / D.C. Higgs, J. T. Colbert // Plant Cell. 1994. — V. 6. — P. 1007−1019.
- Higgs, D.C. Abundance and half-life of the distinct oat phytochrome A3 and A4 mRNA / D.C. Higgs, L.J. Barnes, J.T. Colbert // Plant Mol.Biol. 1995. -V. 29.-P. 367−377.
- Ho, T.D. Response of barley aleurone layers to abscisic acid / T.D. Ho, J.E. Varner // Plant Physiol. 1979. — V. 57. — P. 175−178.
- Hoat, T.X. Specific cleavage of ribosomal RNA and mRNA during victorin-induced apoptotic cell death in oat / T.X. Hoat et al. // Plant J. 2006. — V. 46. -P. 922−933.
- Holmberg, L. Probing the structure of mouse Ehrlich ascites cell 5.8S, 18S and 28S ribosomal RNA in situ / L. Holmberg, Y. Melander, and O. Nygard // Nucleic Acids Res. 1994. — V. 22. — P. 1374−1382.
- Houge G. Selective cleavage of 28S rRNA variable regions V3 and V13 in myeloid leukemia cell apoptosis / G. Houge et al. // FEBS Lett. 1993. — V.315. P. 16−20.
- Houge, G. Finemapping of 28S rRNA sites specifically cleaved in cells undergoing apoptosis / G. Houge et al. // Mol. Cell. Biol. 1995. — V. 15. — P. 2051 -2062.
- Horlitz, M. Gene-specific trans-Regulatory Functions of Magnesium for Chloroplast mRNA Stability in Higher Plants / Horlitz M., P. Klaff // The J. Biol. Chem. 2000. — V. 275. — P. 35 638 — 35 645.
- Hsu, D. Degradation of rRNA in Salmonella Strains: a novel mechanism to regulate the concentration of rRNA and ribosomes / D. Hsu, L.-M. Shih, Y.C. Zee // J. Bacteriol. 1994. — P. 4761−4765.
- Hutchins, C.J. Self-cleavage of plus and minus RNA transcripts of avocado sunblotch viroid / С J. Hutchins et al. // Nucleic Acids Res. 1986. — V. 14. -P. 3627−3640.л I
- Jackson, R.J. Do the poly (A) tail and 3 '-untranslation region control mRNA translation / R.J. Jackson, N. Standart // Cell. 1990. — V. 62. P. 15−24.
- Johnston, W. RNA-catalyzed RNA polymerization: accurate and general RNA-templated primer extension / W. Johnston et al. // Scienc. 2001. — V. 292.-P. 1319−1325.
- Kaplan, R. Decay of ribosomal RNA in Escherichia coli cells starved for various nutrients / R. Kaplan, D. Apirion // J. Biol. Chem. 1975. — V. 250. — P. 3174−3178.
- Kemper, L.D. The role of opaque-2 in the control of lysine-degradingactivities in developing maize endosperm / L.D. Kemper // The Plant Cell. -1999. -V. 11. P. 1981−1993.
- Klaff, P. mRNA decay in spinach chloroplast: psbA mRNA degradation is initiated by endonucleotic cleavage within the coding region / P. Klaff // Nucleic Acids Res. 1995. — V. 23, № 23. — P. 4885−4892.
- Klaff, P. RNA structure and regulation of gene expression / P. Klaff, G. Riesner, G. Steger // Plant Mol. Biol. 1996. — V. 32. P. 89−106.
- Klein, D.J. The contribution of metal ions to the structural stability of the large ribosomal subunit / D.J. Klein, P.B. Moore, T.A. Steitz // RNA. 2004. -V. 10.-P. 1366−1379.
- Koculi, E. Charge density of divalent metal cations determines RNA stability / E. Koculi et al. // J. Am. Chem. Soc. 2007. — V. 129. — P. 2676−2682.
- Kodrzycky, R. The Opaque-2 mutation of maize differentially reduces zein gene transcription / R. Kodrzycky, R.S. Boston, B.A. Larkins // Cell. 1989. V. l.-P. 105−114.
- Konstantinova, I.M. The specific endoribonuclease activity of small nuclear and cytoplasmic a-RNPs / I.M. Konstantinova et al. // FEBS Lett. 1999. — V. 462.-P. 407−410.
- Krikorian, Ch.R. In vitro mRNA degradation system to study the virion host shutoff function of Herpes simplex virus / Ch.R. Krikorian and G. S. Read // J. of Virology. 1991. — V. 65. — P. 112−122.
- Kuai, L. Polyadenylation of rRNA in Saccharomyces cerevisiae / L. Kuai et al. // Proc. Natl. Ac. Sci. USA. 2004. — V. 101. — P. 8581−8586.
- Laloi, M. Plant cold-induced uncoupling protein / M. Laloi et al. // Nature. -1997.-V. 389.-P. 135−136.
- Lamattina, L. Estimation of rRNA synthesis and degradation rates insenescing wheat leaves / L. Lamattina et al. // Arch. Biochem. Biophys. -1988.-V. 260.-P. 285−292.
- Lange, H. Degradation of a polyadenylated rRNA maturation by-product involves one of the three RRP6-like proteins in Arabidopsis thaliana / H. Lange et al. // Molecular and Cellular Biology. 2008. — V. 28, No. 9. — P. 30 383 044.
- Leaver, C. J. The molecular integrity of chloroplast ribosomal ribonucleic acids / C.J. Leaver, J. Ingle // Biochem. J. 1971. — V. 123. — P. 235−243.
- Leffers, H. The sequence of 28S ribosomal RNA varies within and between human cell lines / H. Leffers, A. H. Andersen // Nucleic Acids Res. 1993. — V. 21.-P. 1449−1455.
- Lewandowska, M. Polyadenylation and decay of 26S rRNA as part of Nicotiana tabacum response to cadmium / M. Lewandowska et al. // Acta Biochimica Polonica. 2007. — V. 54. — P. 747−755.
- Li, Z. The soybean SAUR open reading frame contains a cis-element responsible for cycloheximid-induced mRNA accumulation / Z .Li et al. // Plant Mol. Biol. 1994. — V. 24. — P. 715−723.
- Li, Z. Exoribonucleases and endoribonucleases/ Z .Li, M.P. Deutscher // EcoSal-Escherichia coli and Salmonella: Cellular and Molecular Biology: editor Curtiss R. III. Washington, DC: ASM Press- 2004. — Chapter 4.6.3.
- Lincoln, J.E. Diverse mechanism for the regulation of ethylene-inducible gene expression I J.E. Lincoln, R.L. Fischer // Mol. Gen. Genet. 1988. — V. 212.-P. 71−75.
- Lu, Y. K. Characterization of the thylakoid membrane in a chlorophyll-deficient ch5 mutant of Arabidopsis thaliana / Y. K. Lu, С. M. Yang, and Y. R. Chen // Bot. Bull. Acad. Sin. 1995. — V. 36. — P. 33−40.
- Lupoid, D.S. Polyadenylation occurs at multiple sites in maize mitochondrial cox2 mRNA and is independent of editing status / D.S. Lupoid, A.G. Caoile, D.B. Stern//Plant Cell.-1999. V. 11.-P. 1565−1578.
- Mackie, G. O. Evolution of cnidarians giant axons / G. O. Mackie // Evolutionof the first nervous systems: ed. P. A. V. Anderson. NY.: Plenum, 1989. — P. 395−407.
- Marcotte, W.R.J. Abscisic acid-responsive sequence from the Em gene of wheat / W.R.J. Marcotte, S.H. Russel, R.S. Quatrano // Plant Cell. 1989. -V.l. -P.969−976.
- Margossian, L.J. Ethylene-regulated expression of a tomato fruit ripening gene encoding a proteinase inhibitor I with a glutamatic residue at the reactive site / L.J. Margossian et al. // Proc. Natl. Ac. Sci. USA. 1988. — V.85. -P.8012−8016.
- Maruyama, H.B. Agglutination of bacterial spheroplast: agglutination-dependent of Escherichia coli ribosomal ribonucleic acid / H.B. Maruyama // J. Bacteriol. 1973. — V. 115. — P. 47−51.
- Marzluff, W. F. Multiple regulatory steps control histone mRNA concentrations / W. F. Marzluff, N. Pandey // ZBS. 1988. — V. 13. — P. 49−69.
- Melefors, O. Genetic studies of cleavage-initiated mRNA decay and processing of ribosomal 9S RNA show that the Escherichia coli ams and rne loci are the same / O. Melefors, A. von Gabain // Mol. Microbiol. — 1991. — V. 5.-P. 857−864.
- Miller, L.L. Thermal injury and recovery of Bacillus subtilis / L.L. Miller, Z. J. Ordal //Appl. Microbiol. 1972. — V. 24. — P. 878−884.
- Misra, V.K. The linkage between magnesium binding and RNA folding / V.K. Misra and D.E. Draper// J. Mol. Biol. 2002. — V. 317. — P. 507−521.
- Moon, J. The Ubiquitin-Proteasome Pathway and Plant Development / J. Moon, G. Parry, M. Estelle //The Plant Cell. 2004. — V. 16. — P. 3181 — 3196.
- Morelli, J.K. Biphasic stimulation of translational activity correlates with induction of elongation factor 1 subunit a upon wounding in potato tubes / J.K. Morelli, Ch.K. Shewmaker, M.E. Vayda // Plant Physiol. 1994. — V. 106. — P. 897−903.
- Moss, E.G. RNA interference: is a small RNA world / E.G. Moss // Curr. Biol.-2001.-V. 11.-P. 772−775.
- Mullet, J. E. Transcription and RNA stability are important determinants of higher plant chloroplast RNA levels / J. E. Mullet, R. R. Klein // EMBO J. -1987.-V. 6.-P. 1571−1579.
- Mulligan, R.M. Transcriptional and posttranscriptional regulation of maize mitochondrial gene expression R.M. / Mulligan, P Leon, V. Walbot // Mol. Cell. Biol.-1991.-V. 11.-P. 533−543.
- Munroe, D. Tales of poly (A) / D. Munroe, A. A. Jacobson // Gene. 1990. -V.91.-P. 151−158.
- Murphy, D. Vasopressin RNA in the neural lobe of the pituitary: dramatic accumulation in response to salt loading / D. Murphy, A Levy, S Lightman, D. Carter // Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 1989. — V.86. — P. 9002−9005.
- Newman, T.C. DST sequences, highly conserved among plant SAUR genes, target reported transcripts for rapid decay in tobacco/ T.C. Newman et al.// Plant Cell. 1993. -V. 5. — P. 701−714.
- Nakabayashi, K. Genome-wide profiling of store mRNA in Arabidopsis thaliana seed germination: epigenetic and genetic regulation of transcription in seed / K. Nakabayashi et al. // The Plant Journal. 2005. — V. 41. — P. 697−709.
- Nissen, P. The structural basis of ribosome activity in peptide bond synthesis / P. Nissen et al. // Science. 2000. — V. 289. — P. 920−930.
- Pan, T. Divalent metal ions in RNA folding and catalysis / T. D. Pan, M. Long, and О. C. Uhlenbeck. // The RNA world: ed. R. F. Gesteland, and J. F. Atkins. N.Y.: Cold Spring Harbor Laboratory Press, Cold Spring Harbor, 1993. — P. 271−302.
- Pelletier, J. Insertion mutagenesis to increase secondary structure within the 5' noncoding region of a eukaryotic mRNA reduces translational efficiency / J.
- Pelletier, N. Sonenberg // Cell. 1985. — V.40, № 3. — P. 515−526.
- P6rez-Amador, M.A. Identification of BFN1, a bifunctional nuclease induced during leaf and stem senescence in Arabidopsis / M.A. Perez-Amador et al. // Plant Physiol.-2000.-V. 122.-P. 169−179.
- Peumans, W.J. Some aspects of the synthesis of long-lived messenger ribonucleopro-teins in developing rye embryos / W.J. Peumans, L.I. Caers, A.R. Carlier // Planta. 1979. — V. 144. — P. 485−490.
- Plotnikov, V.K. Differential stability of zein mRNA in developing corn kernel / V.K. Plotnikov, N.B. Bakaldina // Plant Molecular Biology. 1996. — V. 31. -P. 507−515.
- Raghavan, B. Seed germination // Developmental Biology of Flowering Plants. Springer-Verlag, New York. 2000. — P. 7−24.
- Rajjou, L. The effect of a-amanitin on the Arabidopsis seed proteome highlights the distinct roles of stored and neosynthesized mRNAs during germination / L. Rajjou et al. // Plant Physiol. 2004. — V. 134.- P. 1598−1613.
- Ren, Y.-G. Coordination of divalent metal ions in the active site of poly (A)-specific ribonuclease / Y.-G. Ren, L.A. Kirsebom, A. Virtanen // J. Biol. Chem. 2004. — V.47. — P. 48 702−48 706.
- Reverdatto, S.V. mRNA deadenylation by PARN is essential for embryogenesis in higher plants / S.V. Reverdatto et al. // RNA. 2004. — V. 10.-P. 1200- 1214.
- Ross, J. H4 histone messenger RNA decay in cell free extracts initiates at or near the 3' terminus and proceeds 3' to 5' / J. Ross, G. Kobs // J. Mol. Biol. -1986.-V. 188.-P. 579−591.
- Ross, J. Messenger RNA turnover in eukaryotic cells / J. Ross // Mol. Biol. Med. 1988. — V. 5.-P. 1−12.
- Ross, J. Control of messenger RNA stability in higher eukaryotes / J. Ross // Trends Genet. 1996. — V. 12. — P. 171−175.
- Rothnie, H.M. Plant mRNA З'-end formation / H.M. Rothnie // Plant Mol. Biol. -1996.-P.43−61.
- R6mer, R. tRNA conformation and magnesium binding. A study of a yeast phenylalanine-speeific tRNA by a fluorescent indicator and differential melting curves / R. Romer and R. Hach // Eur. J. Biochem. V. 55. — P. 271−284.
- Sachs, A. B. Messenger RNA degradation in eukaryotes / A. B. Sachs // Cell. 1993. — V. 74. — P. 413−421
- Santiago, Т. C. The relationship between mRNA stability and length in Saccharomyces cerevisiae / Т. C. Santiago et al. // Nucl. Acids Res. 1987. -V. 15.-P. 2417−2428.
- Saville, B.J. A site-specific self-cleavage reaction performed by a novel RNA in Neurospora mitochondria / B.J. Saville, R. A Collins // Cell. 1990. — V. 61. -P. 685−696.
- Seeley, K.A. Distribution of phytochrome and chlorophyll-a/b-binding-protein mRNAs in etiolated Avena seedlings / K.A. Seeley, J.T. Colbert // Planta J. — 1992. -V. 187,№ 4. P. 532−536.
- Seeley, K.A. Red light-independent instability of oat phytochrome mRNA in vivo / K.A. Seeley, D.H. Byrne, J.T. Colbert // Plant Cell. 1992. — V. 4. — P. 29−38.
- Segal, G. A New Opaque Variant of Maize by a Single Dominant RNA-Interference-Inducing Transgene / G. Segal, R. Song, J. Messing // Genetics. -2003.-V. 165.-P. 387−397.
- Schoenberg, D.R. Ribonucleases involved in eukaryotic mRNA turnover / D.R. Schoenberg, E. Chernokalskaya // mRNA metabolism and post-transcriptional gene regulation: eds. J.B. Harford and D.R. Morris. NY.: Wiley Press, 1997. — P. 217−240.
- Shapiro, D. J. Regulation of messenger RNA stability in eukaryotic cells / D. J. Shapiro, J. E. Blume, D. A. Nielsen // BioEssays. 1987.- V. 6.- P. 221−232.
- Shaul, O. Magnesium transport and function in plants: the tip of the iceberg / O. Shaul // Biometals. 2002. — V. 15. — P. 309−323.
- Shaw, G. A conserved AU sequence from the 3'untranslated region of GM-CSF mRNA mediates selective mRNA degradation / G. Shaw, R. Kamen //
- Cell. 1986. — V. 46. — P. 659−678.
- Sheng, J. Negative and positive regulation of a novel praline-rich protein mRNA by fungal elicitor and wounding / J. Sheng, R. D’Ovidio, M.C. Mehdy // Plant J. 1991.-V. 1.-P. 345−354.
- Sheu, J.-J. Control of transcription and mRNA turnover as mechanisms of metabolic repression of alpha-amylase gene expression / J.-J. Sheu et al. // Plant J. 1994. — V. 5. — P. 655−664.
- Shirly, B.M. A potential role for mRNA turnover in the light regulation of plant expression: ribulose-1.5-bisphosphate carboxylase small subunit in soybean / B.M. Shirly, R.B. Meagher // Nucleic Acids Res. 1990. — V. 18. — P. 3377−3385.
- Silengo, L. Stabilization of mRNA with polar effects in an Escherichia coli mutant / L. Silengo // Mol. Gen. Genet. 1974. — V. 134, № 1. — P. 7−19.
- Skott, W.G. The crystal structure of an all-RNA hammerhead ribozyme: a proposed mechanism for RNA catalytic cleavage / W.G. Skott, J.T. Finch, A. Klug//Cell. 1995. — V. 81.-P. 991−1002.
- Slomovic, S. Polyadenylation of ribosomal RNA in human cells / S. Slomovic et al. // Nucleic Acids Res. 2002. — V. 34. — P. 2966−2975.
- Sobol, P.T. ICP0 prevents RNase L-independent rRNA cleavage in Herpes simplex virus type 1-infected cells / P.T. Sobol, Mossman K. L. // J. of Virology. 2006. — V. 80. — P. 218−225.
- Sperrazza, J.M. Quantitation of cation binding to wheat germ ribosomes: influences on subunit association equilibria and ribosome activity/ J.M. Sperrazza, L.L. Spremulli // Nucleic Acids Res. 1983. — V. 11. — P. 2665 -2679.
- Spirin, A.S. Eukaryotic messenger RNA and informosomes. Omnia mea mecumporto / A.S. Spirin // FEBS Lett. 1978. — V. 88. — P. 15−17.
- Stelzer, R. X-ray microprobe analyses of vacuoles of spruce needle mesophyll, endodermis and transfusion parenchyma cells at different seasons of the year / R. Stelzer et al. // Botanica Acta. 1990. — V 103. — P. 415−423.
- Stern, D.B. Control of plastid gene expression: 3' inverted repeats act as mRNA processing and stabilizing elements, but do not terminate transcription / D.B. Stern, W. Gruissem // Cell. 1987. — V. 51. — P. 1145−1157.
- Sullivan, M.l. Posttranscriptional regulation of nuclear-encoded genes in higer plants: the role of mRNA stability and translation / M.l. Sullivan, P.J. Green // Plant Mol. Biol. 1993. — V. 23. — P. 1091−1104.
- Sunitha, I. An in vitro system derived from Friend erythroleukemia cells to study messenger RNA stability / I. Sunitha, L. I. Slobin // Biochem. Biophys. Res. Commun. 1987. — V. 144. — P. 560−574.
- Susi, P. Characteristics of RNA silencing in plant similarities and differences across kingdoms / P. Susi, M. Hohkuri, T. Wahlroos // Plant Mol. Biol. 2004. -V. 54, № 1.-P. 25−38.
- Thompson, A. Regulation of gene expression in develop pea seed / Thompson, A.: Ph. D. thesis Durham Univ., 1989. 146 p.
- Taylor, C.B. RNS2: A senescence-associated RNase of Arabidopsis that diverged from the S-RNases before speciation / C.B. Taylor et al. // Proc. Natl. Ac. Sci. USA. 1993. — V. 90. — P. 5118−5122.
- Taylor, C.B. Identification and characterization of genes with unstable transcripts (GUTs) in tobacco / C.B. Taylor, P.J. Green // Plant Mol. Biol. -1995.-V. 28.-P. 27−38.
- Thomashow, M.F. Role of cold-responsive genes in plant freezing tolerance / M.F. Thomashow // Plant Physiol. 1998. — V. 118. — P. 1−7.
- Timofeeva, A.V. Size distribution of the urokinase mRNA decay intermediates in different tissues and cell lines / A.V. Timofeeva et al. // Biochim. Biophys. Acta. 2000. — V. 1517. -.P. 33−45.
- Tomlins, R.I. Precursors ribosomal ribonucleic acid and ribosomeaccumulation in vivo during the recovery of Salmonella typhimurium from thermal injuiy / R.I. Tomlins, Z.J. Ordal // J. Bacterid. 1971. — V. 107. — P. 134−142.
- Topp, H .-Whole-body degradation rates of transfer-, ribosomal-, and messenger ribonucleic acids and resting metabolic rate in 3- to 18-уеаг-оЫ humans / H Topp, Schoch G. // Pedeatric Res. 2000. — V. 47. — P. 163−175.
- Venkov, P.V. Differential stability of 28S and 18S rat liver ribosomal ribonucleic acids / P.V. Venkov, A.A. Hadjiolov // Biochem. J. 1969. — V. 115. -P. 91−94.
- Vincent, H.A. Substrate recognition and catalysis by the exoribonuclease Rnase R / H.A. Vincent, M.P. Deutscher // J. Biol. Chem. 2006. — V. 281. — P. 29 769−29 775.
- Wasilewska, L.D. Preferential stimulation of the plant mRNA synthesis by gibberellic acid / L.D. Wasilewska, K. Kleczkowski // Eur. J. Biochem. — 1976. -V. 66, № 2.-P. 405112.
- Waters, L.C. Ribonucleic acid synthesis in germinating cotton seeds / L.C. Waters, L.S.III Dure // J. Mol. Biol. 1966. — V. 19. — P. 1−27.
- Wertz, I.E. Diverse molecular provocation of programmed cell death / I.E.
- Wertz, M.R. Hanley // Trends Biochem Sci. 1996. — V. 21. — P. 359−364.
- Wickens, M. Life and death in the cytoplasm: messages from З'-end / M. Wickens, P. Anderson, R.J. Jackson. // Curr. Opin. In Gen. & Dev. 1997. — V. 7. — P. 220−232.
- Winkles, J.I. Drosophila ribosomal RNA stability increases during slow growth conditions / J.I. Winkles, W.H. Phillips, R.M. Granger // J. Biol. Chem.- 2006. V. 260. — P. 7716−7720.
- Wreshner, D.H. Differential mRNA stability to reticulocyte ribonucleases correlates with 3' noncoding (U)nA sequences / D.H. Wreshner, G. Rechavi // Eur. J. Biochem. 1988. — V. 172. — P. 333−340.
- Wu, L. The formation З'-end in plants / L. Wu, T. Ueda, J. Messing // Plant J.- 1995.-V. 8.-P. 323−329.
- Yen, Y. Identification and properties of the major ribonucleases of Arabidopsis thaliana / Y. Yen, P. J. Green // Plant Physiol. 1991. — V. 97. — P. 1487−1493.
- Zhang, S. Fungal elicitor-induced bean prolinerich protein mRNA down regulation is due to destabilisation that is transcription and translation dependent / S. Zhang et al. // Plant Cell. 1993. — V. 5. — P. 1089−1099.
- Zhang, S. Binding of a 50-kD protein toa U-rich sequence in an mRNA encoding a proline-rich protein that is destadilized by fungal elicitor / S. Zhang, M.C. Mehdy // Plant Cell. 1994. -V. 6. — P. 135−145.
- Zhang, S. The role of RNA polemerase IV in plant small RNA metabolism / S. Zhang et al. // Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 2007. — V. 104. — P. 4536 -4546.