Список использованных источников

Abu bakar S, Kumar S, Loke KK, Goh HH, Mohd noor N. DNA shotgun sequencing analysis of Garcinia mangostana L. variety Mesta. Genom Data. 2017/12, p. 118−119.

A new method to extract and purify DNA from allophanic soils and paleosols, and potential for paleoenvironmental reconstruction and other applications [Электронный ресурс]. — Электрон. текстовые дан. и граф. дан. — Geoderma Volume 274. — Yu-Tuan Huanga et al.— Режим доступа: http://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0016706116301501, свободный. (дата обращения: 28.05.17);

ANI [Электронный ресурс]. — Электрон. текстовые дан. и граф. дан. — Режим доступа: http://gall-id.cgrb.oregonstate.edu/wgs-ani.html, свободный. (дата обращения: 28.05.17);

Bernhard O. Palsson Systems Biology. Constraint-based Reconstruction and Analysis. — New York: Cambridge University press, 2015. — ISBN: 9 781 107 038 851;

Douglas Lind, Brian Marcus, An introduction to symbolic dynamics and coding. — New York: Cambridge University Press, 1995;

Drmanac R, Drmanac S, Chui G, et al. Sequencing by hybridization (SBH): advantages, achievements, and opportunities. Adv Biochem Eng Biotechnol. 2002/77, p. 75−101;

Enno Ohlebusch. Bioinformatics Algorithms — Sequence Analysis, Genome Rearrangements, and Phylogenetic Reconstruction. — Oldenbusch Verlag, 2013;

Expressed sequence tags [Электронный ресурс]. — Электрон. текстовые дан. — Режим доступа: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/19 277 571, свободный. (дата обращения: 28.05.17);

Frequently Asked Questions about Genetic testing [Электронный ресурс]. — Электрон. текстовые дан. и граф. дан. — Режим доступа: https://www.genome.gov/19 516 567/, свободный. (дата обращения: 28.05.17);

GenBank [Электронный ресурс]: Материал из Википедии — свободной энциклопедии: Версия 59 480 684, сохранённая в 12:09 UTC 28 мая 2017 / Авторы Википедии // Википедия, свободная энциклопедия. — Электрон. дан. — Сан-Франциско: Фонд Викимедиа, 2017. — Режим доступа: http://ru.wikipedia.org/?oldid=59 480 684;

Genetic testing [Электронный ресурс]. — Электрон. текстовые дан. и граф. дан. — Режим доступа: https://ghr.nlm.nih.gov/primer/testing/genetictesting, свободный. (дата обращения: 28.05.17);

Goris J, Konstantinidis KT, Klappenbach JA, Coenye T, Vandamme P, Tiedje JM. DNA-DNA hybridization values and their relationship to whole-genome sequence similarities. Int J Syst Evol Microbiol. 57 (pt. 1), p. 81−91;

L. Allison, L. Stern, T. Edgoose, and T. I. Dix. Sequence Complexity for Biological Sequence Analysis. Computers and Chemistry, 24(1), p. 43−55;

Markus Hsi-Yang Fritz, Rasko Leinonen, Guy Cochrane, et al. Efficient storage of high throughput DNA sequencing data using reference-based compression. — Genome Res, 2011;

Mitchell L Model. Bioinformatics Programming Using Python. Practical Programming for Biological Data. — O'Reilly Media, 2009.

Peter Ligeti, Combinatorics on words and its applications [Электронный ресурс]. — Электрон. текстовые дан. и граф. дан. — Режим доступа: http://www.cs.elte.hu/~turul/ligeti_tezisek_angol.pdf, свободный. (дата обращения: 28.05.17).

Peter Ligeti, Peter Sziklai, Reconstruction from subwords [Электронный ресурс]. — Электрон. текстовые дан. и граф. дан. — Режим доступа: http://www.cs.elte.hu/~sziklai/cikk/icai.pdf, свободный. (дата обращения: 28.05.17);

Preparation of Yeast DNA Sequencing Libraries [Электронный ресурс]. — Электрон. текстовые дан. и граф. дан. — Katja Schwartz and Gavin Sherlock. — Режим доступа: http://cshprotocols.cshlp.org/content/2016/10/pdb.prot088930.full.pdf, свободный. (дата обращения: 28.05.17);

Study on the Super Eulerian Path and the Sequence Reconstruction [Электронный ресурс]. — Электрон. текстовые дан. и граф. дан. — Jia Xingui, Xiao Xiang, Jiang Kaizhong. — Global Journal of Mathematics Vol. 7, No. 1. — Режим доступа: http://www.gpcpublishing.org/index.php/gjm/article/view/438/pdf₇₅, свободный. (дата обрашения: 28.05.17);

V. I. Levenshtein, Reconstruction of objects from a minimum number of distorted specimens, Dokl. Ross. Akad. Nauk, 1997, 354, No. 5, 593−596;

V. K. Leont’ev, Yu. G. Smetanin, Problems of information on the set of words, J. Math. Sci., 2000, 108, No. 1, 49−70, Kluwer Acad./Consult. Bureau, New York;

Yoon SH, Ha SM, Lim J, Kwon S, Chun J. A large-scale evaluation of algorithms to calculate average nucleotide identity. Antonie Van Leeuwenhoek. 2017;

What is DNA? [Электронный ресурс]. — Электрон. текстовые дан. и граф. дан. — Режим доступа: http://www.livescience.com/37 247-dna.html, свободный. (дата обращения: 28.05.17).

Алгоритм Ахо-Корасик [Электронный ресурс]. — Электрон. текстовые дан. и граф. дан. — Режим доступа: https://neerc.ifmo.ru/wiki/index.php?title=Алгоритм_Ахо-Корасик, свободный. (дата обращения: 28.05.17);

Гамильтонов граф [Электронный ресурс]: Материал из Википедии — свободной энциклопедии: Версия 82 104 143, сохранённая в 05:00 UTC 25 ноября 2016 / Авторы Википедии // Википедия, свободная энциклопедия. — Электрон. дан. — Сан-Франциско: Фонд Викимедиа, 2016. — Режим доступа: http://ru.wikipedia.org/?oldid=82 104 143;

Гасфилд Д. Строки, деревья и последовательности в алгоритмах: Информатика и вычислительная биология / Пер. с англ. И. В. Романовского. — 2-е изд. — СПб.: Невский Диалект, 2003. — 654 с.;

Дворкин М. Э Методы минимизации необходимого числа цепей для секвенирования ДНК. — Спб.: СПбГУ ИТМО, кафедра компьютерных технологий, 2010.

Дезоксирибонуклеиновая кислота [Электронный ресурс]: Материал из Википедии — свободной энциклопедии: Версия 70 073 698, сохранённая в 20:56 UTC 28 мая 2017 / Авторы Википедии // Википедия, свободная энциклопедия. — Электрон. дан. — Сан-Франциско: Фонд Викимедиа, 2017. — Режим доступа: http://ru.wikipedia.org/?oldid=70 073 698;

Задача коммивояжёра [Электронный ресурс]: Материал из Википедии — свободной энциклопедии: Версия 84 128 691, сохранённая в 03:46 UTC 8 марта 2017 / Авторы Википедии // Википедия, свободная энциклопедия. — Электрон. дан. — Сан-Франциско: Фонд Викимедиа, 2017. — Режим доступа: http://ru.wikipedia.org/?oldid=84 128 691;

Интервальный граф [Электронный ресурс]: Материал из Википедии — свободной энциклопедии: Версия 67 251 501, сохранённая в 20:31 UTC 9 декабря 2016 / Авторы Википедии // Википедия, свободная энциклопедия. — Электрон. дан. — Сан-Франциско: Фонд Викимедиа, 2016. — Режим доступа: http://ru.wikipedia.org/?oldid=67 251 501;

Исследование алгоритмов восстановления слов в целях восстановления кода ДНК [Электронный ресурс]: Вадим Дробинин. — Электрон. текстовые дан. и граф. дан. — Режим доступа: https://www.hse.ru/data/2015/07/09/1 082 887 252/Презентация_Дробинин.pdf, свободный. (дата обращения: 28.05.17);

Контиг [Электронный ресурс]: Материал из Википедии — свободной энциклопедии: Версия 53 534 044, сохранённая в 14:48 UTC 14 марта 2017 / Авторы Википедии // Википедия, свободная энциклопедия. — Электрон. дан. — Сан-Франциско: Фонд Викимедиа, 2017. — Режим доступа: http://ru.wikipedia.org/?oldid=53 534 044;

Лексикографический поиск в ширину [Электронный ресурс]: Материал из Википедии — свободной энциклопедии: Версия 78 836 559, сохранённая в 21:47 UTC 7 октября 2016 / Авторы Википедии // Википедия, свободная энциклопедия. — Электрон. дан. — Сан-Франциско: Фонд Викимедиа, 2016. — Режим доступа: http://ru.wikipedia.org/?oldid=78 836 559;

Локус [Электронный ресурс]: Материал из Википедии — свободной энциклопедии: Версия 68 906 992, сохранённая в 19:58 UTC 27 февраля 2017 / Авторы Википедии // Википедия, свободная энциклопедия. — Электрон. дан. — Сан-Франциско: Фонд Викимедиа, 2017. — Режим доступа: http://ru.wikipedia.org/?oldid=68 906 992;

" Матрица" матричных РНК, Метрополь [Электронный ресурс]. — Электрон. текстовые дан. и граф. дан. — Режим доступа: http://mtrpl.ru/journal-club-XXIX, свободный. (дата обращения: 28.05.17).

Мультиграф [Электронный ресурс]: Материал из Википедии — свободной энциклопедии: Версия 69 710 690, сохранённая в 11:18 UTC 1 апреля 2017 / Авторы Википедии // Википедия, свободная энциклопедия. — Электрон. дан. — Сан-Франциско: Фонд Викимедиа, 2017. — Режим доступа: http://ru.wikipedia.org/?oldid=69 710 690;

Нормальные числа. Эпизод II: атака де Брёйна [Электронный ресурс]. — Электрон. текстовые дан. и граф. дан. — Режим доступа: http://www.pvsm.ru/matematika/48 400, свободный. (дата обращения: 28.05.17);

Преимплантационная генетическая диагностика [Электронный ресурс]: Материал из Википедии — свободной энциклопедии: Версия 76 567 466, сохранённая в 04:50 UTC 20 февраля 2016 / Авторы Википедии // Википедия, свободная энциклопедия. — Электрон. дан. — Сан-Франциско: Фонд Викимедиа, 2016. — Режим доступа: http://ru.wikipedia.org/?oldid=7 656 746;

Расстояние Левенштейна [Электронный ресурс]: Материал из Википедии — свободной энциклопедии: Версия 84 432 190, сохранённая в 17:49 UTC 22 марта 2017 / Авторы Википедии // Википедия, свободная энциклопедия. — Электрон. дан. — Сан-Франциско: Фонд Викимедиа, 2017. — Режим доступа: http://ru.wikipedia.org/?oldid=8 443 219;

Рибонуклеиновая кислота [Электронный ресурс]: Материал из Википедии — свободной энциклопедии: Версия 68 394 333, сохранённая в 15:09 UTC 5 февраля 2017 / Авторы Википедии // Википедия, свободная энциклопедия. — Электрон. дан. — Сан-Франциско: Фонд Викимедиа, 2017. — Режим доступа: http://ru.wikipedia.org/?oldid=68 394 333;

Сметанин Ю.Г., Ульянов М. В. Реконструкция слов по конечному мультимножеству подслов в гипотезе сдвига 1. I. Реконструкция без запретов. — Кибернетика и системный анализ. 2014. № 1. с. 168−177;

Сметанин Ю.Г., Ульянов М. В. Реконструкция слов по конечному мультимножеству подслов в гипотезе сдвига 1. II. Реконструкция при наличии запрещенного блока. — Кибернетика и системный анализ. 2015;

Снова о биоинформатике: сборка бактериальных геномов [Электронный ресурс]. — Электрон. текстовые дан. и граф. дан. — Режим доступа: https://habrahabr.ru/company/spbau/blog/186 492/, свободный. (дата обращения: 28.05.17).