Фенотипический и молекулярно-генетический анализ измененных вариантов Vibrio cholerae биовара эльтор
Диссертация
Штаммов V. cholerae OI классического и эльтор биоваров и дифференциации эльтор вибрионов на типичные и измененные методом мультилокусной полимеразной цепной реакции с электрофоретическим учетом результатов (Ген Vibrio cholerae вариант cí-xfí—РЭФ)" позволяет выявлять измененные варианты холерного вибриона биовара эльтор. Впервые проведенный комплексный фенотипический… Читать ещё >
Список литературы
- Бароян О.В. Холера Эль-Тор. Текст. М., Медицина, 1971.
- Гинцбург А.Л., Янишевский Н. В., Мотин В. Л. с соавт. Организация и клонирование структурных генов энтеротоксина Vibrio cholerae eltor RV79 Текст. // Мол. генет., микробиол. и вирусол. 1984. — № 9. — С. 12−18-
- Заднова С.П., Ливанова Л. Ф., Крепостнова И. М. с соавт. Комплексная гено-и иммунодиагностическая тест-система для идентификации холерных вибрионов Ol и Ol39 серогруппы и оценки их вирулентности. Текст. Патент РФ № 2 404 257, опубликован 20.11.10 г.
- Информационный бюллетень ВОЗ, 2011. N107.
- Исаев Н.Д. Фенотипический и генетический анализ изогенных вариантов холерного вибриона с альтернативным уровнем экспрессии факторов патогенности и персистенции Текст.: диссертация. кандидата биологических наук: 03.00.07, 03.00.04. Саратов, 2007. 149с.
- Кузьмиченко И.А., Громова О. В., Джапаридзе М. Н. с соавт. Тест среды для определения активности твиназы, протеазы и фосфолипазы в холерной химической вакцины и её компонентах Текст. // Пробл. особо опасных инф. 2002. — Вып. 83. — С. 148−152.
- Лабораторная диагностика холеры. Методические указания МУ 4.2.2218−07. Текст. Москва. 2007.
- Ю.Ломов Ю. М. Эволюция возбудителя холеры и прогноз по этой инфекции на ближайшее будущее Текст. // Эпидемиология и инфекционные болезни. -2004.-№ 1.р. 7−12.
- П.Маниатис Т., Фрич Э., Сэмбрук Дж. Молекулярное клонирование Текст. М., 1984.-480с.
- Миронова Л.В., Балахонов C.B., Урбанович Л .Я. с соавт. Обнаружение «гибридных» штаммов Vibrio cholerae Eltor при эпидемических осложнениях в Сибири и на Дальнем Востоке Тескт. // Журн. микробиол., эпидемиол. и иммунобиол. — 2011. — N5. — С. 12−18.
- Монахова Е.В., Ломов Ю. М., Михась Н. К., Писанов Р. В. Структура и изменчивость неполного СТХ-элемента холерных вибрионов Текст. // Пробл. особо опасных инф. 2007. — Вып. 93. — С. 58−61.
- Москвитина Э.А., Мазрухо А. Б., Адаменко О. Л., Кругликов В. Д. Холера в начале XXI века. Прогноз на глобальном уровне Текст. // Пробл. особо опасных инф.-2012.-Вып. 111.-С. 11−16.
- Нефедов К.С. Сравнительный анализ фенотипических и молекулярно-генетических свойств холерных вибрионов эльтор, выделенных до начала и в период седьмой пандемии холеры Текст.: диссертация. кандидата медицинских наук: 03.00.07, Саратов, 2009. 153с.
- Организация работы лабораторий, использующих методы амплификации нуклеиновых кислот при работе с материалом, содержащим микроорганизмы I-IV групп патогенности МУ 1.3.2569 -09 Текст. М. 2009.
- Осин A.B., Нефедов К. С., Ерошенко Г. А., Смирнова Н. И. Сравнительный анализ геномов холерных вибрионов эльтор, выделенных до начала и в разные периоды седьмой пандемии холеры Текст. // Генетика. 2005. — Т.41, № 1. — С.1−10.
- Осина H.A., Бугоркова Т. В., Коннова С. С. с соавт. Способ детекции и определения биотипа, серогруппы и токсигенности возбудителя холеры и набор для его осуществления Текст. Патент РФ № 2 360 972, опубликован 10.07.10 г.
- Подосинникова JI. С. Холерные вибрионы, выделенные на территории СССР в период седьмой пандемии Текст.: автореф. диссертации. доктора медицинских наук. Саратов, 1993. — 44с.
- Смирнова Н.И. Генетический контроль патогенности Vibrio cholerae: умеренный нитевидный фаг СТХ, кодирующий холерный токсин, и остров «патогенности» Текст. // Мол. генет., микробиол. и вирусол. 1999. — № 4. -С. 3−10.
- Смирнова Н.И., Кутырев В. В. Эволюция возбудителя холеры Текст. // Мол. генет., микробиол. и вирусол. 2004. — № 4. — С. 3−13.
- Смирнова Н.И., Горяев A.A., Кутырев В. В. Эволюция генома возбудителя холеры в современный период Текст. // Мол. генет., микробиол. и вирусол. 2010. -№ 4. — С.11−19.
- Справочник по микробиологическим и вирусологическим методам исследования Текст. М., Медицина. 1982. С. 463.
- Телесманич Н.Р., Непомнящая Н. Б., Винокур Н. И. Гемолизины холерных вибрионов как липопротеиновые полиферментные комплексы Текст. // Сборник материалов проблемной комиссии «Холера и патогенные вибрионы». Ростов-на-Дону, 2001. Вып. 14. — С. 52−55.
- Телесманич Н.Р., Мишанькин М. Б. Биологическая роль гемоцитолизина холерных вибрионов Текст. // Сборник материалов проблемной комиссии «Холера и патогенные вибрионы». Ростов-на-Дону, 2002. Вып. 15. — С. 4649.
- Тудор В., Страти И. Оспа. Холера. Текст. Бухарест. -1981. 360с.
- Урбанович Л.Я., Марамович A.C., Балахонов C.B. с соавт. Ускоренные методы лабораторной диагностики в системе эпиднадзора за холерой Текст. //113
- Сборник материалов проблемной комиссии «Холера и патогенные для человека вибрионы». Ростов-на-Дону. — 2007. — Вып. 20. — С. 43−46.
- Челдышова Н.Б. Дифференциация штаммов Vibrio cholerae Ol с различной эпидемической значимостью на основании четырех генов вирулентности: ctxA, tcpA, toxR и hapA Текст.: диссертация. кандидата медицинских наук. -Саратов,-2002.- 173с.
- Щелканова Е.Ю., Горяев A.A., Смирнова Н. И. Изменение генома профага СТХф Vibrio cholerae биовара эльтор, вызываемое транспозоном Tn5-Mob Текст. // Мол. генет., микробиол. и вирусол. 2008. — № 3. — С. 11−17.
- Alam М., Nusrin S., Islam А. et al. Cholera between 1991 and 1997 in Mexico was associated with Infection by Classical, El Tor, and El Tor Variants of Vibrio cholerae Text. 11 J. Clin. Microbiol. 2010. — Vol. 48, N10. — P. 3666−3674.
- Albert M.J., Bhuiyan N.A., Talukder K.A. et al. Phenotypic and genotypic changes in Vibrio cholerae 0139 Bengal Text. // J. Clin. Microbiol. 1997. -Vol. 35, N10.-P. 2588−2592.
- Ang G.Y., Yu C.Y., Balqis K. et al. Molecular evidence of cholera outbreak caused by a toxigenic Vibrio cholerae Ol El tor variant strain in Kelantan, Malaysia Text. 11 J. Clin. Microbiol. 2010. — Vol. 48, N11. — P. 3963−3969.
- Bakhshi В., Pourshafie M.R., Navabakbar F., Tavakoli A. Genomic organization of the CTX element among toxigenic Vibrio cholerae isolates Text. // Clin. Microbiol. Infect. 2008. — Vol. 14. — P. 562−568.
- Beck N.A., Krukonis E.S., DiRita V.J. TcpH influences virulence gene expression in Vibrio cholerae by inhibiting degradation of the transcription activator TcpP Text. //J. Bacteriol. 2004. — Vol. 186, N24. — P. 8309−8316.
- Bhaskaran K., Rowley D. Nutritional studies on Vibrio cholerae Text. // J. Gen. Microbiol. 1956. — Vol. 15, N2. — P. All All.
- Bhuiyan N.A., Nusrin S., Alam M. et al. Changing genotypes of cholera toxin (CT) of Vibrio cholerae 0139 in Bangladesh and description of three new CT genotypes Text. //FEMS Immunol. Med. Microbiol. 2009. — Vol. 57, N2. -P.136−41.
- Blokesch M., Schoolnik G.K. Serogroup conversion of Vibrio cholerae in aquatic reservoirs Text. // PLoS Pathog. 2007. — Vol. 3, N6. — e81.
- Booth B.A., Boesman-Finkelstein M., Finkelstein R.A. Vibrio cholerae hemagglutinin/protease nicks cholera enterotoxin Text. // Infect. Immun. 1984. -Vol. 45, N3.-P. 558−560.
- Borkakoty B., Biswas D., Devi U. et al. Emergence of classical ctxB genotype 1 and tetracycline resistant strains of Vibrio cholerae 01 El Tor in Assam, India 11 Tropical Med. Hyg. 2012. — Vol. 106. — P. 382−386.
- Carroll P.A., Tashima K.T., Rogers M.B. et al. Phase variation in tcpH modulates expression of the ToxR regulon in Vibrio cholerae Text. // Mol. Microbiol. -1997.-Vol. 25, N6.-P. 1099−1111.
- Chatterjee S., Patra T., Ghosh K. et al. Vibrio cholerae 01 clinical strains isolated in 1992 in Kolkata with progenitor traits of the 2004 Mozambique variant Text. //J. Med. Microbiol. 2009. — Vol. 58. — P. 239−247.
- Chiang S.L., Taylor R.K., Koomey M., Mekalanos J.J. Single amino acid substitutions in the N-terminus of Vibrio cholerae TcpA affect colonization, autoagglutination, and serum resistance Text. // Mol Microbiol. 1995. -Vol. 17, N6.-P. 1133−1142.
- Chin C.S., Sorenson J., Harris J.B. et al. Origin of the Haitian cholera outbreak strain Text. // N. Engl. J. Med. 2011. — Vol. 364, N1. — P. 33−42.
- Choi S.Y., Lee J.H., Jeon Y.S. et al. Multilocus variable-number tandem repeat analysis of Vibrio cholerae Ol El Tor strains harbouring classical toxin В Text. // J. Med. Microbiol. 2010. — Vol. 59. — P. 763−769.
- Chow K.H., Ng J.T.K., Yuen K.Y., Yami W.C. Detection of RTX toxin gene in Vibrio cholerae by PCR Text. I I J.Clin.Microbiol. 2001. — Vol. 30. — P. 25 942 597.
- Chun J., Grim C.J., Hasan N.A. et al. Comparative genomics reveals mechanism for short-term and long-term clonal transitions in pandemic Vibrio cholerae Text. // Proc. Natl. Acad. Sei. USA. 2009. — Vol. 106, N36. — P. 15 442−15 447.
- Cook W.L., Wachsmuth K., Johnson S.R. et al. Persistence of plasmids, cholera toxin genes, and prophage DNA in classical Vibrio cholerae Ol Text. 11 Infect. Immun. 1984.-Vol. 45, N1.-P. 222−226.
- Das В., Halder К., Pal P., Bhadra R.K. Small chromosomal integration site of classical CTX prophage in Mozambique Vibrio cholerae Ol biotype El Tor strain Text. // Arch. Microbiol. 2007. — Vol. 188, N6. — P. 677−683.
- Davis B.M., Kimsey H.H., Kane A.V., Waldor M.K. A satellite phage-encoded antirepressor induces repressor aggregation and cholera toxin gene transfer Text. // EMBO J. 2002. — Vol. 21. — P. 4240−4249.
- De Haan L., Hirst T.R. Cholera toxin: a paradigm for multi-functional engagement of cellular mechanisms Text. // Mol. Membr. Biol. 2004. — Vol. 21, N2. — P.77−92.
- De S.N., Chatterjee D.N. Experimental study of mechanism of action of Vibrio cholerae on intestional mucous membrane Text. // J. Path. Bacteriol. 1953. -Vol. 66.-P. 559−562.
- Dubey R.S., Lindblad M., Holmgren J. Purification of El Tor cholera enterotoxins and comparisons with classical toxin Text. // J. General Microbiol. 1990. — Vol. 136. — P.1839−1847.
- Dutta N.K., Habbu M.K. Experimental cholera in infant rabbits: a method for chemotherapeutic investigation Text. // Br. J. Pharmacol. Chemother. 1955. -Vol. 10, N2. -P.153−159.
- Dziejman M., Balon E., Boyd D. et al. Comparative genomic analysis of Vibrio cholerae: genes that correlate with cholera endemic and pandemic disease Text. // Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 2002. — Vol. 99, N3. — P. 1556−1561.
- Dziejman M., Serruto D., Tam V.C. et al. Genomic characterization of non-Ol, non-0139 Vibrio cholerae reveals genes for a type III secretion Text. // Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 2005. — Vol. 102, N9. — P. 3465−3470.
- Edwards M.C., Gibbs R.A. Multiplex PCR: adwantages, development and applications Text. // PCR Methods and Applications. 1994. — Vol.3. — P. 65−75.
- Epstein P.R., Ford T.E., Colwell R.R. Health and climate change: Marine ecosystems Text. // Lancet. 1993. — Vol. 342. — P. 1216−1219.
- Faruque S.M., Alim A.R., Rahman M.M. et al. Clonal relationships among classical Vibrio cholerae 01 strains isolated between 1961 and 1992 in Bangladesh Text. //J. Clin. Microbiol. 1993. — Vol. 31, N9. — P. 2513−2516.
- Faruque S.M., Nair G.B. Vibrio cholerae: Genomics and Molecular Biology. Text. Caister Academic Press. Eds. 2008.
- Faruque S.M., Zhu J., Asadulghani et al. Examination of diverse toxin-coregulated pilus-positive Vibrio cholerae strains fails to demonstrate evidence for Vibrio pathogenicity island phage Text. // Infect. Immun. 2003. — Vol. 71, N6. -P. 2993−2999.
- Faruque S.M.A., Kamruzzaman M., Nandi R.K., Ghosh A.N. et al. RSI of polymerase chain reaction-generated amplicons to identify three types of cholera toxin subunit B in Vibrio cholerae Ol strains Text. // J. Clin. Microbiol. 2002. -Vol. 31.-P. 22−25.
- Faruque S.M.A., Tarn V.C., Chowdhury N. et al. Genomic analysis of the Mozambique strain of Vibrio cholerae Ol reveals the origin of El Tor strains carrying classical CTX prophage Text. // Proc. Natl. Acad. Sei. USA. 2007. -Vol. 104.-P. 5151−5156.
- Fasano A., Baudry B., Pumplin D.W. et al. Vibrio cholerae produces a second en-terotoxin, which affects intestinal tight junctions Text. // Proc. Natl. Acad. Sei. -1991.-Vol. 88.-P. 5242−5246.
- Fields P.I., Popovic T., Wachsmuth K., Olsvik O. Use of polymerase chain reaction for detection of toxigenic Vibrio cholerae Ol strains from the Latin American cholera epidemic Text. // J. Clin. Microbiol. 1992. — Vol. 30, N8. — P. 21 182 121.
- Finkelstein R.A., Atthasampunna P., Chulasamaya M., Charunmethee P. Pathogenesis of experimental cholera: biologic activities of purified procholeragen a Text. // J. Immunol. 1966. — Vol. 96, N3. — P. 440−449.
- Finkelstein RA., Boesman-Finkelstein M., Chang Y., Hase С. Vibrio cholerae hemagglutinin/protease, colonial variation, virulence and detachment // Infect. Immun. 1992. — Vol. 60. — P. 472−478.
- Galen J.E., Ketley J.M., Fasano A. et al. Role of Vibrio cholerae neuraminidase in the function of cholera toxin Text. // Infect. Immun. 1992. — Vol. 60, N2. -P. 406−415.
- Ghosh-Banerjee J., Senoh M., Takahashi T. Cholera toxin production by the El Tor variant of Vibrio cholerae 01 compared to prototype El Tor and classical biotypes Text. // J. Clin. Microbiol. 2010. — Vol. 48, N 11. — P. 4283−4286.
- Goel A.K., Jain M., Kumar P. et al. A new variant of Vibrio cholerae Ol El Tor causing cholera in India // J. Infect. 2008. — Vol. 57. — P. 280−281.
- Goel A.K., Ponmariappan, S., Kamboj, D.V., Singh, L. Single multiplex polymerase chain reaction for environmental surveillance of toxigenic-pathogenic Ol and non-Ol Vibrio choleras Text. // Folia Microbiol. 2007. — Vol. 52. — P. 81−85.
- Grim C.J., Choi J., Chun J. et al. Occurrence of the Vibrio cholerae seventh pandemic VSP-I island and a new variant Text. //OMICS. 2010. — Vol. 14, N1. -P. 1−7.
- Grissa I., Vergnaud G., Pourcel C. The CRISPRdb database and tools to display CRISPRs and to generate dictionaries of spacers and repeats. BMC Bioinformatics 2007- 8:172. электронный ресурс. http://crispr.u-psud.fr/crispr/CRISPRHomePage.php.
- Halder K., Das B., Nair G.B., Bhadra R.K. Molecular evidence favouring stepwise evolution of Mozambique Vibrio cholerae Ol El Tor hybrid strain Text. // Microbiology. 2010. — Vol. 156. — P. 99−107.
- Haralalka S., Nandi S., Bhadra R.K. Mutation in the relA gene of Vibrio cholerae affects in vitro and in vivo expression of virulence factors Text. // J. Bacteriol. -2003. Vol. 185, N16. — P. 4672−4682.
- Hase C.C., Finkelstein R.A. Cloning and nucleotide sequence of the Vibrio cholerae hemagglutinin/protease (HA/protease) gene and construction of an HA/protease-negative strain Text. // J. Bacteriol. 1991. — Vol. 173, N 11. -P. 3311−3317.
- Hassan F., Kamruzzaman M., Mekalanos J.J., Faruque S.M. Satellite phage TLCcp enables toxigenic conversion by CTX phage through dif site alteration Text. // Nature.-2010.-Vol. 467, N7318.-P. 982−985.
- Heidelberg J.F., Eisen J.A., Nelson W.C. et al. DNA sequence of both chromosomes of the cholera pathogen Vibrio cholerae Text. // Nature. 2000. -Vol. 406.-P. 477−483.
- Heilpern A. J., Waldor M. K. pIIICTX, a predicted CTXcp minor coat protein, can expand the host range of coliphage fd to include Vibrio cholerae Text. // J. Bacteriol.-2003.-Vol. 185.-P. 1037−1044.
- Hendriksen R.S., Price L.B., Schupp J.M. et al. Population genetics of Vibrio cholerae from Nepal in 2010: evidence on the origin of the Haitian outbreak Text. // MBio. 2011. — Vol. 2, N4. — eOO 157−11.
- Iredell J.R., Manning P.A. Biotype-specific tcpA genes in Vibrio cholerae Text. // FEMS Microbiol. Lett. 1994. — Vol. 121. — P. 47−54.
- Iwanaga M., Yamamoto K., Higa N. et al. Culture conditions for stimulating cholera toxin production by Vibrio cholerae 01 El Tor Text. // Microbiol. Immunol. 1986.-Vol. 30, N11.-P. 1075−1083.
- Jermyn W.S., Boyd E.F. Characterization of a novel Vibrio pathogenicity island (VPI-2) encoding neuraminidase (nanH) among toxigenic Vibrio cholerae isolates Text. // Microbiology. 2002. — Vol. 148. — P. 3681−3693.
- Jermyn W.S., Boyd E.F. Molecular evolution of Vibrio pathogenicity island-2 (VPI-2): mosaic structure among Vibrio cholerae and Vibrio mimicus natural isolates Text. //Microbiology.-2005.-Vol. 151.-P. 311−322.
- Jonson G., Holmgren J., Svennerholm A. M. Identification of a mannose-binding pilus on Vibrio cholerae El Tor Text. // Microb. Pathog. 1991. -Vol. 11.-P. 433−441.
- Jonson G., Holmgren J., Svennerholm A.-M. Epitope differences in toxin-coregulated pili produced by classical and El Tor Vibrio cholerae 01 Text. // Microbial Pathogenesis. 1991.-Vol. 11.-P. 179−188.
- Joshi R.M., Albert M.J. Hybrid El Tor Vibrio cholerae Ol, Kuwait Text. // Emerg. Infect. Dis. 2009. — Vol. 15, N11.-P. 1879−1880.
- Kaper J.B., Morris J.G., Levine M.M. Cholera Text. // Clin. Microbiol. Rev. -1995.-Vol. 8.-P. 48−86.
- Karaolis D.K., Kaper J.B. Vibrio cholerae TCP: a trifunctional virulence factor? Response Text. // Trends Microbiol. 1999. — Vol. 7. — P. 393.
- Karaolis D.K., Johnson J.A., Bailey C.C. et al. A Vibrio cholerae pathogenicity island associated with epidemic and pandemic strains Text. // Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 1998. — Vol. 95, N6. — P. 3134−3139.
- Karaolis D.K., Lan R., Reeves P.R. Molecular evolution of the sevenih-pandemic clone of Vibrio cholerae and its relationship to other pandemic and epidemic V cholerae isolates Text. // J. Bacteriol. 1994. — Vol. 176, N20. -P.6199−6206.
- Kato J., Zhu J., Liu C., Moss J. Enhanced sensivity to cholera toxin in ADPribosylarginine hydrolase-deficient mice Text. // Mol. Cell. Biol. 2007. — Vol.12 127, N 15.-P. 5534−5543.
- Keasler S.P., Hall R.H. Detecting and biotyping Vibrio cholerae 01 with multiplex polymerase chain reaction Text. // Lancet. 1993. — Vol.341. — P. 1661.
- Kimsey H.H., Waldor M.K. The CTXphi repressor RstR binds DNA cooperatively to form tetrameric repressor-operator complexes Text. // J. Biol. Chem. -2004. Vol. 279, N4. — P. 2640−2647.
- Kimsey H.H., Waldor M.K., CTXcp immunity: application in the development of cholera vaccines Text. // Proc. Natl. Acad. Sei. U.S.A. 1998. — Vol. 95. -P.7035−7039.
- Kirn T.J., Jude B.A., Taylor R.K. A colonization factor links Vibrio cholerae environmental survival and human infection Text. // Nature. 2005. — Vol. 438. -P. 863−866.
- Kitaoka M., Miyata S.T., Unterweger D., Pukatzki S. Antibiotic resistance mechanisms of Vibrio cholerae Text. // J. Med. Microbiol. 2011. — Vol. 60. -P. 397−407.
- Krukonis E.S., Yu R.R., Dirita V.J. The Vibrio cholerae ToxR/TcpP/ToxT virulence cascade: distinct roles for two membrane-localized transcriptional activators on a single promoter Text. // Mol Microbiol. 2000. — Vol. 38, N1. — P. 6784.
- Kumar P., Jain M., Goel A.K. et al. A large cholera outbreak due to a new cholera toxin variant of the Vibrio cholerae Ol El Tor biotype in Orissa, Eastern India // J. Med. Microbiol. 2009. — Vol. 58. — P. 234−238.
- Kumar P., Jain M., Goel A.K. et al. Rapid detection of virulence-associated genes in environmental strains of Vibrio cholerae by multiplex PCR Text. // Curr. Microbiol. 2010. — Vol. 60. — P. 199−202.
- Lee J.H., Choi S.Y., Jeon Y.S. et al. Classification of hybrid and altered Vibrio cholerae strains by CTX prophage and RSI element structure Text. // J. Microbiol. 2009. — Vol. 47, N6. — P.783−788.
- Lin W., Fullner K.J., Clayton R. et al. Identification of a Vibrio cholerae RTX toxin gene cluster that is tightly linked to the cholera toxin prophage Text. // Proc. Natl. Acad. Sei. USA. 1999. — Vol. 96, N3. — P. 1071−1076.
- Longini I.M. Jr., Yunus M., Zaman K. et al. Epidemic and endemic cholera trends over a 33-year period in Bangladesh Text. // J. Infect. Dis. 2002. — Vol. 186, N2.-P. 246−251.
- Mahon B.E., Mintz E.D., Greene K.D. et al. Reported cholera in the United States, 1992−1994: a reflection of global changes in cholera epidemiology Text. // JAMA. 1996. — Vol. 276, N4. — P. 307−312.
- Maiti D., Das B., Saha A. et al. Genetic organization of pre-CTX and CTX prophages in the genome of an environmental Vibrio cholerae non-Ol, non-0139 strain Text. //Microbiology. 2006. — Vol. 152, Pt.12. — P. 3633−3641.
- McLeod S.M., Kimsey H.H., Davis B.M., Waldor M.K. CTXphi and Vibrio cholerae: exploring a newly recognized type of phage-host cell relationship Text. // Mol. Microbiol. 2005. — Vol.57, N2. — P.347−356.
- McLeod S.M., Waldor M.K. Characterization of XerC- and XerD-dependent CTX phage integration in Vibrio cholerae Text. // Mol. Microbiol. 2004. — Vol. 54, N4.-P. 935−947.
- Meibom K.L., Blokesch M., Dolganov N.A. et al. Chitin induces natural competence in Vibrio cholerae Text. // Science. 2005. — Vol. 310, N5755. -P. 1824−1827.
- Mekalanos J.J. Duplication and amplification of toxin genes in Vibrio cholerae Text. // Cell. 1983. — Vol. 35, N 1. — P. 253−263.
- Miller V.L., Mekalanos J.J. Synthesis of cholera toxin is positively regulated at the transcrip-tional level by toxR Text. // Proc. Notl. Acad. Sei. USA. 1984. -Vol.81.-P. 3471−3475.
- Mojica F. J., Diez-Villasenor C., Garcia-Martinez J., Soria E. Intervening sequences of regularly spaced prokaryotic repeats derive from foreign genetic elements Text. // J. Mol. Evol. 2005. — Vol. 60. — P. 174−182.
- Mojica F. J., Diez-Villasenor C., Soria E., Juez G. Biological significance of a family of regularly spaced repeats in the genomes of Archaea, Bacteria and mitochondria Text. // Mol. Microbiol. 2000. — Vol. 36. — P. 244−246.
- Morita M., Ohnishi M., Arakawa E. et al. Emergence and genetic diversity of El Tor Vibrio cholerae 01 that possess classical biotype ctxB among travel-associated cases of cholera in Japan Text. // J. Med. Microbiol. 2010. — Vol.59.- P.708−12.
- Mukhopadhyay A.K., Garg S., Saha P.K. et al. Comparative analysis of factors promoting optimal production of cholera toxin by Vibrio cholerae 01 (classical and El Tor biotypes) and 0139 // Indian J. Med. Res. 1996. — Vol. 104. — P. 129 133.
- Murley Y.M., Carroll P.A., Skorupski K. et al. Differential transcription of the tcpPH operon confers biotype-specific control of the Vibrio cholerae ToxR virulence regulon Text.//Infect. Immun. 1999. -Vol. 67, N10.-p. 5117−5123.
- Murphy R.A., Boyd E.F. Three pathogenicity islands of Vibrio cholerae can excise from the chromosome and form circular intermediates Text. // J. Bacteriol.- 2008. Vol. 190, N2. — P. 636−647.
- Nair G. B., Qadri F., Holmgren J. et al. Cholera due to altered El Tor strains of Vibrio cholerae 01 in Bangladesh Text. // J. Clin. Microbiol. 2006. — Vol.44. -P.4211−4213.
- Na-Ubol M., Srimanote P., Chongsa-nguan M. et al. Hybrid & El Tor variant biotypes of Vibrio cholerae 01 in Thailand Text. // Indian. J. Med. Res. 2011. -Vol.133, N4.-P.387−394.
- Nguyen B.M., Lee J.H., Cuong N.T. et al. Cholera outbreaks caused by an altered Vibrio cholerae Ol El Tor biotype strain producing classical cholera toxin B in Vietnam in 2007 to 2008 // J. Clin. Microbiol. 2009. — Vol.47. — P. 1568−1571.
- Okada K., Chantaroj S., Roobthaisong A. et al. A cholera outbreak of the Vibrio cholerae Ol El Tor variant carrying classical ctxB in Northeastern Thailand in 2007 Text. // Am. J. Trop. Med. Hyg. 2010. — Vol.82, N5. — P.875−878.
- O’Shea Y.A., Boyd E.F. Mobilization of the Vibrio pathogenicity island between Vibrio cholerae isolates mediated by CP-T1 generalized transduction Text. // FEMS Microbiol. Lett. 2002. — Vol. 214, N2. — P. 153−157.
- O’Shea Y.A., Reen F.J., Quirke A.M., Boyd E.F. Evolutionary genetic analysis of the emergence of epidemic Vibrio cholerae isolates on the basis of comparative nucleotide sequence analysis and multilocus virulence gene profiles Text. // J
- Clin Microbiol. 2004. — Vol. 42, N10. — P. 4657−4671.125
- Panda S.K., Patra A.K., Kar R.N. Monitoring of multiple drug-resistant pathogens in a selected stretch of Bay of Bengal, India Text. // Environ. Monit. Assess. -2012.-Vol. 184, N1. P.193−200.
- Parsot C., Mekalanos J.J. Expression of the Vibrio cholerae gene encoding aldehyde dehydrogenase is under control of ToxR, the cholera toxin transcriptional activator Text. //J. Bacteriol. 1991. — Vol. 173, N9. — P. 2842−2851.
- Patra T., Chatterjee S., Raychoudhuri A. et al. Emergence and progression of Vibrio cholerae 01 El Tor variants and progenitor strains of Mozambique variants in Kolkata, India Text. // Int. J. Med. Microbiol. 2011. — Vol. 301, N4. — P. 310−317.
- Pearson G.D.N., Woods A., Chiang S.L., Mekalanos J.J. CTX genetic element encodes a site specific recombination system and an intestinal colonization factor Text. // Proc. Natl. Acad. Sci. USA 1993. — Vol.90. — P.3750−3754.
- Piarroux R., Barrais R., Faucher B. et al. Understanding the cholera epidemic, Haiti Text.//Emerg. Infect Dis.-2011.-Vol. 17, N7.-P. 1161−1168.
- Popovic T., Fields P.I., Olsvik O. Detection of cholera toxin genes / Vibrio cholerae and cholera: molecular to global perspectives. Ed. I.K. Wachsmuth, P.A. Blake, O. Olsvik. Washington. DC: American Society for Microbiology. 1994. -P. 1−52.
- Prouty M.G., Osorio C.R., Klose K.E. Characterization of functional domains of the Vibrio cholerae virulence regulator ToxT Text. 11 Mol. Microbiol. 2005. -Vol. 58, N4.-P. 1143−1156.
- Prouty M.G., Osorio C.R., Klose K.E.Characterization of functional domains of the Vibrio cholerae virulence regulator ToxT Text. // Mol. Microbiol. 2005. -Vol. 58, N4.-P. 1143−1156.
- Quilici M.L., Massenet D., Gake B. et al. Vibrio cholerae 01 variant with reduced susceptibility to ciprofloxacin, Western Africa Text. // Emerg.Infect. Dis. -2010.-Vol. 16, N11.-P. 1804−1805.
- Raychoudhuri A., Mukhopadhyay A.K., Ramamurthy T. Biotyping of Vibrio cholerae Ol: time to redefine the scheme Text. // Indian. J. Med. Res. 2008. -Vol. 128, N6.-P. 695−698.
- Reguera G., Kolter R. Virulence and the Environment: a Novel Role for Vibrio cholerae toxin-coregulated pili in biofilm formation on chitin Text. // J. Bacterid.-2005.- Vol. 187, N10.-P. 3551−3555.
- Reidl J., Klose K.E. Vibrio cholerae and cholera: out of the water and into the host Text. // FEMS Microbiol. Rev. 2002. — Vol. 26, N2. — P. 125−139.
- Reimer A.R., Van Domselaar G., Stroika S. et al. Comparative genomics of Vibrio cholerae from Haiti, Asia, and Africa Text. // Emerg. Infect. Dis. 2011 -Vol. 17, N11.-P. 2113−2121.
- Rhine J.A., Taylor R.K. TcpA pilin sequences and colonization requirements for Ol and 0139 Vibrio cholerae Text. // Mol.Microbiol. 1994. — Vol. 13. -P.1013−1020.
- Rolfs A., Shuller I., Finkch U., Weber-Rolfs I. PCR: clinical diagnostics and research Text. Springer-Verlag KG, Berlin. 1992. P. 74−77.
- Rollenhagen A., Lubke J.H. The morphology of excitatory central synapses: from structure to function Text. // Cell Tis. Res. 2006. — Vol.326, N2. — P.221−237.
- Rubin E.J., Lin W., Mekalanos J J., Waldor M.K. Replication and integration of a Vibrio cholerae cryptic plasmid linked to the CTX prophage Text. // Mol. Microbiol. 1998.-Vol. 28, N6.-P. 1247−1254.
- Safa A., Bhuyian N.A., Nusrin S. et al. Genetic characteristics of Matlab variants of Vibrio cholerae 01 that are hybrids between classical and El Tor biotypes Text. // J. Med. Microbiol. 2006. — Vol. 55. — P. 1563−1569.
- Safa A., Nair G.B., Kong R.Y.C. Evolution of new variants of Vibrio cholerae 01 Text. // Trends Microbiol. 2010. — Vol.18. — P.46−54.
- Safa A., Sultana J., Cam P.D. et al. Vibrio cholerae Ol hybrid El Tor strains in Asia and Africa Text. // Emerg. Infect. Dis. 2008. — Vol.14. — P.987−988.
- Salles C.A., Momen H., Vicente A.C., Coelho A. Vibrio cholerae in South America: polymerase chain reaction and zymovar analysis Text. // Trans. R. Soc. Trop. Med. Hyg. 1993. — Vol. 87, N3. — P. 272.
- Samadi A.R., Chowdhury M.K., Huq M.I., Khan M.U. Seasonality of classical and El Tor cholera in Dhaka, Bangladesh: 17-year trends Text. // Trans. R. Soc. Trop. Med. Hyg. 1983. -Vol.77, N6. — P.853−856.
- Sanchez J., Holmgren J. Cholera toxin a foe & a friend Text. // Indian J. Med. Res.-2011.-Vol. 133.-P. 153−163.
- Sandkvist M, Bagdasarian M, Howard S.P. Characterization of the multimeric Eps complex required for cholera toxin secretion Text. // J. Med. Microbiol. -2000. Vol. 290, N4−5. — P. 345−50.
- Schneider D.R., Parker C.D. Isolation and characterization of protcasc-deficient mutants of Vibrio cholerae Text. // J. Infect. Dis. 1978. — Vol. 138, N2. -P.143−151.
- Siddique A.K. Nair G.B., Alam M. et al. El Tor cholera with severe disease: a new threat to Asia and beyond Text. // Epidemiol. Infect. 2010. — Vol. 138, N3. — P.347−352.
- Siddique A.K., Baqui A.H., Eusof A., Zaman K. 1988 floods in Bangladesh: pattern of illness and causes of death Text. // J. Diarrhoeal Dis. Res. 1991. -Vol. 9, N4.-P. 310−314.
- Siddique A.K., Zaman K., Akram K. et al. Emergence of a new epidemic strain of Vibrio cholerae in Bangladesh. An epidemiological study Text. // Trop. Geogr. Med. 1994.-Vol. 46, N3.-P. 147−150.
- Singh D.V., Matte M.H., Matte G.R. et al. Molecular analysis of Vibrio cholerae 01, 0139, non-Ol, and non-0139 strains: clonal relationships between clinical and environmental isolates Text. // Appl. Environ. Microbiol. 2001. -Vol. 67, N2.-P. 910−921.
- Sinha V.B., Srivastava B.S. Plasmid-induced loss of virulence in Vibrio cholerae Text. // Nature. 1978. — Vol. 276, N5689. — P.708−709.
- Sporecke I., Castro D., Mekalanos J.J. Genetic mapping of Vibrio cholerae en-terotoxin structural genes Text. // J. Bacteriol. 1984. — Vol. 157, N1. — P. 253 261.
- Svennerholm A.M., Stromberg G.J., Holmgren J. Purification of Vibrio cholerae soluble hemagglutinin and development of enzyme-linked immunosorbent assays for antigen and antibody quantitations Text. // Infect. Immun. 1983. — Vol. 41, N1. — P. 237−243.
- Talkington D., Bopp C., Tarr C. et al. Characterization of toxigenic Vibrio cholerae from Haiti, 2010−2011 Text. // Emerg. Infect. Dis. 2011. — Vol. 17, N11.-P. 2122−2129.
- Tan N.H., Tan C.S. Acidimetric assay for phospholipase A using egg yolk suspension as substrate Text. // Anal. Biochem. 1988. — Vol. 170, N2. — P. 282 288.
- Taneja N., Mishra A., Sangar G., Singh G., Sharma M. Outbreaks caused by new variants of Vibrio cholerae Ol El Tor, India Text. // Emerg. Infect. Dis. -2009. Vol. 15, N 2. — P. 352−354.
- Tappero J.W., Tauxe R.V. Lessons learned during public health response to cholera epidemic in Haiti and the Dominican Republic Text. // Emerg. Infect. Dis. 2011. — Vol. 17, N11. — P. 2087−2093.
- Taviani E., Grim C.J., Choi J. et al. Discovery of novel Vibrio cholerae VSP-II genomic islands using comparative genomic analysis Text. // FEMS Microbiol Lett. 2010. — Vol. 308, N2. — P. 130−137.
- Taylor R.K., Miller V.L., Furlong D.B., Mekalanos J.J. Use of phoA gene fusions to identify a pilus colonization factor coordinately regulated with cholera toxin Text. // PNAS. 1987. — Vol. 84, N9. — P. 2833−2837.
- Tischler A.D., Camilli A. Cyclic diguanylate (c-di-GMP) regulates Vibrio cholerae biofilm formation Text. // Mol. Microbiol. 2004. — Vol. 53, N3. -P. 857−869.
- Tran H.D., Alam M., Trung N.V. et al. Multi-drug resistant Vibrio cholerae Ol variant El Tor isolated in northern Vietnam between 2007 and 2010 Text. // J. Med. Microbiol. 2012. — Vol. 61. — P. 431−437.
- Trucksis M., Galen J.E., Michalski J., Fasano A., Kaper J.B. Accessory cholera enterotoxin (Ace), the third toxin of a Vibrio cholerae virulence cassette Text. // Proc. Natl. Acad. Sei. USA. 1993.-Vol. 90, N11.-P. 5267−5271.
- Voss E., Stephen R. In vitro production of toxin-coregulated pili by Vibrio cholerae El Tor Text. // Attridge Microbial Pathogenesis. 1993. — Vol. 15. — P. 255−268.
- Waldor M.K., Mekalanos J.J. Lysogenic conversion by a filamentous bacteriophage encoding cholera toxin Text. // Science. 1996. — Vol. 272. — P. 1910−1914.
- Waldor M.K., Rubin E.J., Pearson G.D.N, et al. Regulation, replication, and integration functions of the Vibrio cholerae CTX (p are encoded by region RS2 Text. // Mol. Microbiol. 1997. — Vol. 24, N 5. — P. 917−926.
- Withey J.H., Dirita V.J. Vibrio cholerae ToxT independently activates the divergently transcribed aldA and tagA genes Text. // J. Bacteriol. 2005. — Vol. 187, N23.-P. 7890−7900.
- Yu R.R., DiRita V.J. Regulation of gene expression in Vibrio cholerae by ToxT involves both antirepression and RNA polymerase stimulation Text. // Mol. Microbiol. -2002. Vol. 43, N1. — P. 119−134.