К недостаткам E-learning можно отнести:
большие затраты времени на разработку курса;
в некоторых случаях невозможность модификации разработанного курса (записанные на CD-диски и пр.);
отсутствие мотивации обучающегося;
кадровые проблемы, связанные с подготовкой преподавателей, способных и желающих разрабатывать и постоянно обновлять свои курсы, так как разработка электронного учебного контента требует специфических знаний от всех участников этого процесса;
недостаточная компьютерная грамотность обучающих и обучаемых;
при дистанционном обучении в основном не предусматривается личное общение с преподавателем. Однако развитие каналов коммуникации позволяет частично нивелировать данный недостаток за счет применения средств видеоконференцсвязи и электронной почты.
Итак, становление и развитие ЭО тесно связано как с развитием инновационных технологий, так и общества в целом. На сегодняшний день электронное обучение и мобильные устройства позволяют учиться везде: в дороге, на работе, дома. Этот процесс обучения характеризуется не только высокой степенью автономности обучающихся, но и творческой, и игровой составляющей, а также коллективной работой над проблемами и задачами. Меняется также и роль преподавателя, который оказывается практически на равных с учащимся в современном мире доступной информации. Развитие ЭО, отражая изменения в обществе, предлагает задуматься о новых учебном контексте и компетенциях, которыми должны обладать современные студенты и магистранты.